Name | Module | Coverage (%) | Time (s) | Nb Threads | GFLOP/s | Deviation (coverage) | Deviation (time) |
gcc | icc | icx | gcc | icc | icx | gcc | icc | icx | gcc | icc | icx | gcc | icc | icx | gcc | icc | icx |
bool _INTERNAL8eaaea23::__kmp_wait_template<kmp_flag_64<false, true>, true, false, true>(kmp_info*, kmp_flag_64<false, true>*, void*) | libiomp5.so | 28.72 | 24.45 | 31.5 | 19.86 | 13.36 | 23.04 | 51 | 51 | 51 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 5.45 | 3.62 | 5.25 | 3.62 | 1.89 | 3.79 |
nbnxm_kernel_ElecEw_VdwLJCombLB_F_2xmm(NbnxnPairlistCpu const*, nbnxn_atomdata_t const*, interaction_const_t const*, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_output_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 22.04 | NA | 21.01 | 15.24 | NA | 15.37 | 52 | NA | 52 | 2374.22 | NA | 2274.65 | 0.41 | NA | 0.42 | 0.26 | NA | 0.29 |
nbnxm_kernel_ElecEw_VdwLJCombLB_F_2xmm(NbnxnPairlistCpu const*, nbnxn_atomdata_t const*, interaction_const_t const*, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_output_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 28.41 | NA | NA | 15.53 | NA | NA | 52 | NA | NA | 2383.04 | NA | NA | 0.46 | NA | NA | 0.24 | NA |
fft5d_execute(fft5d_plan_t*, int, gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7 | 5.03 | NA | 7.02 | 3.48 | NA | 5.14 | 52 | NA | 52 | 0.00 | NA | 0.00 | 1.12 | NA | 0.84 | 0.76 | NA | 0.61 |
gather_f_bsplines(gmx_pme_t const*, float const*, bool, PmeAtomComm const*, splinedata_t const*, float) | libgromacs_mpi.so.7 | 4.97 | NA | 4.23 | 3.44 | NA | 3.09 | 52 | NA | 52 | 345.56 | NA | 324.21 | 1.73 | NA | 1.57 | 1.16 | NA | 1.14 |
nbnxm_kernel_ElecEw_VdwLJCombLB_VF_2xmm(NbnxnPairlistCpu const*, nbnxn_atomdata_t const*, interaction_const_t const*, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_output_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 3.3 | NA | 3.1 | 2.28 | NA | 2.26 | 52 | NA | 52 | 2708.89 | NA | 2661.00 | 0.11 | NA | 0.12 | 0.07 | NA | 0.09 |
fft5d_execute(fft5d_plan_t*, int, gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 5.38 | NA | NA | 2.94 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.45 | NA | NA | 0.24 | NA |
spread_on_grid(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, pmegrids_t const*, bool, bool, float*, bool, int) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 4.78 | NA | NA | 3.5 | NA | NA | 52 | NA | NA | 7.45 | NA | NA | 0.56 | NA | NA | 0.40 |
nbnxm_kernel_ElecEw_VdwLJCombLB_VF_2xmm(NbnxnPairlistCpu const*, nbnxn_atomdata_t const*, interaction_const_t const*, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_output_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 4.29 | NA | NA | 2.34 | NA | NA | 52 | NA | NA | 2697.61 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 0.06 | NA |
spread_on_grid(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, pmegrids_t const*, bool, bool, float*, bool, int) [clone .extracted.11] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 4.29 | NA | NA | 3.14 | NA | NA | 52 | NA | NA | 112.10 | NA | NA | 1.04 | NA | NA | 0.76 |
spread_on_grid(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, pmegrids_t const*, bool, bool, float*, bool, int) [clone ._omp_fn.1] | libgromacs_mpi.so.7 | 4.26 | NA | NA | 2.94 | NA | NA | 52 | NA | NA | 102.61 | NA | NA | 1.06 | NA | NA | 0.71 | NA | NA |
_ZN17_INTERNAL8eaaea2326__kmp_hyper_barrier_gatherE12barrier_typeP8kmp_infoiiPFvPvS3_ES3_..0 | libiomp5.so | 1.44 | 1.06 | 1.71 | 0.99 | 0.58 | 1.25 | 52 | 51 | 52 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 3.13 | 2.30 | 3.80 | 2.11 | 1.22 | 2.76 |
gather_f_bsplines(gmx_pme_t const*, float const*, bool, PmeAtomComm const*, splinedata_t const*, float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 3.8 | NA | NA | 2.08 | NA | NA | 52 | NA | NA | 582.74 | NA | NA | 1.26 | NA | NA | 0.66 | NA |
spread_on_grid(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, pmegrids_t const*, bool, bool, float*, bool, int) [clone ._omp_fn.2] | libgromacs_mpi.so.7 | 3.58 | NA | NA | 2.47 | NA | NA | 52 | NA | NA | 2.17 | NA | NA | 0.52 | NA | NA | 0.35 | NA | NA |
mkl_dft_avx512_owns_cRealRecombine_32f | libmkl_avx512.so.2 | NA | 1.85 | 0.9 | NA | 1.01 | 0.66 | NA | 52 | 52 | NA | 60.51 | 92.61 | NA | 0.43 | 0.25 | NA | 0.23 | 0.18 |
_INTERNALae0e43be::reduce_threadgrid_overlap(gmx_pme_t const*, pmegrids_t const*, int, float*, float*, float*, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 2.74 | NA | NA | 1.5 | NA | NA | 52 | NA | NA | 4.89 | NA | NA | 0.23 | NA | NA | 0.12 | NA |
solve_pme_yzx(gmx_pme_t const*, t_complex*, float, bool, int, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 1.87 | NA | 0.78 | 1.29 | NA | 0.57 | 52 | NA | 52 | 212.81 | NA | 474.77 | 0.12 | NA | 0.08 | 0.08 | NA | 0.06 |
clearForceBuffer(nbnxn_atomdata_t*, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 1.29 | NA | 1.35 | 0.89 | NA | 0.99 | 52 | NA | 52 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.22 | NA | 0.20 | 0.15 | NA | 0.14 |
_INTERNAL1bba7552::gmx::lincs_matrix_expand(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs const&, _INTERNAL1bba7552::gmx::Task const&, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<float const>, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<float>, _INTERNAL1bba7552::gmx::Array... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 2.33 | NA | NA | 1.27 | NA | NA | 52 | NA | NA | 268.84 | NA | NA | 0.28 | NA | NA | 0.15 | NA |
gmx::lincs_matrix_expand(gmx::Lincs const&, gmx::Task const&, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 2.25 | NA | NA | 1.64 | NA | NA | 52 | NA | NA | 88.27 | NA | NA | 0.24 | NA | NA | 0.17 |
void __kmp_dispatch_deo<unsigned long long>(int*, int*, ident*) | libiomp5.so | 1.92 | NA | NA | 1.33 | NA | NA | 51 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.20 | NA | NA | 0.13 | NA | NA |
_INTERNAL8eaaea23::__kmp_hyper_barrier_gather(barrier_type, kmp_info*, int, int, void (*)(void*, void*), void*) | libiomp5.so | 0.67 | 0.44 | 0.75 | 0.46 | 0.24 | 0.55 | 51 | 48 | 52 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 1.42 | 1.06 | 1.66 | 0.95 | 0.57 | 1.21 |
void _INTERNALecfc3c36::clearBufferFlagged<3>(nbnxn_atomdata_t const&, int, gmx::ArrayRef<float>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 1.67 | NA | NA | 0.91 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.27 | NA | NA | 0.14 | NA |
_INTERNALae0e43be::make_bsplines(float**, float**, int, float (*) [3], int, int const*, float const*, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 1.62 | NA | NA | 0.88 | NA | NA | 52 | NA | NA | 200.22 | NA | NA | 0.51 | NA | NA | 0.27 | NA |
_INTERNALae0e43be::spread_coefficients_bsplines_thread(pmegrid_t const*, PmeAtomComm const*, splinedata_t*, pme_spline_work*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 1.61 | NA | NA | 0.88 | NA | NA | 52 | NA | NA | 219.97 | NA | NA | 0.50 | NA | NA | 0.27 | NA |
nbnxn_atomdata_add_nbat_f_to_f_reduce(nbnxn_atomdata_t*, int) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 1.6 | NA | NA | 1.17 | NA | NA | 52 | NA | NA | 24.48 | NA | NA | 0.19 | NA | NA | 0.13 |
kmp_flag_native<unsigned long long, (flag_type)1, true>::notdone_check() | libiomp5.so | 0.51 | 0.42 | 0.55 | 0.35 | 0.23 | 0.41 | 52 | 52 | 52 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.15 | 0.10 | 0.09 | 0.10 | 0.05 | 0.07 |
nbnxn_atomdata_add_nbat_f_to_f_reduce(nbnxn_atomdata_t*, int) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 1.46 | NA | NA | 1.01 | NA | NA | 52 | NA | NA | 27.56 | NA | NA | 0.17 | NA | NA | 0.12 | NA | NA |
L__ZN17_INTERNALa817b2b737nbnxn_atomdata_add_nbat_f_to_f_reduceEP16nbnxn_atomdata_ti_1188__par_region0_2_51 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 1.33 | NA | NA | 0.73 | NA | NA | 52 | NA | NA | 39.67 | NA | NA | 0.21 | NA | NA | 0.11 | NA |
nbnxn_kernel_prune_2xnn(NbnxnPairlistCpu*, nbnxn_atomdata_t const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.87 | NA | 0.44 | 0.6 | NA | 0.32 | 52 | NA | 52 | 956.00 | NA | 1743.00 | 0.07 | NA | 0.05 | 0.05 | NA | 0.03 |
mkl_dft_avx512_ipps_cFFTfwd_64_32fc | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.64 | 0.62 | NA | 0.35 | 0.46 | NA | 52 | 52 | NA | 277.94 | 205.22 | NA | 0.14 | 0.17 | NA | 0.07 | 0.13 |
copy_fftgrid_to_pmegrid(gmx_pme_t*, float const*, float*, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 1.17 | NA | 0.04 | 0.81 | NA | 0.03 | 52 | NA | 52 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.14 | NA | 0.02 | 0.10 | NA | 0.01 |
gmx::lincs_matrix_expand(gmx::Lincs const&, gmx::Task const&, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 1.11 | NA | NA | 0.77 | NA | NA | 52 | NA | NA | 32.83 | NA | NA | 0.25 | NA | NA | 0.17 | NA | NA |
fftwf_codelet_n1fv_13_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 1.09 | NA | NA | 0.75 | NA | NA | 52 | NA | NA | 82.52 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 0.10 | NA | NA |
mkl_dft_avx512_mg_rowbatch_plain_bwd_096_s | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.6 | 0.49 | NA | 0.33 | 0.36 | NA | 52 | 52 | NA | 817.46 | 781.33 | NA | 0.07 | 0.11 | NA | 0.04 | 0.08 |
PairlistSet::constructPairlists(gmx::InteractionLocality, Nbnxm::GridSet const&, gmx::ArrayRef<PairsearchWork>, nbnxn_atomdata_t*, gmx::ListOfLists<int> const&, int, t_nrnb*, SearchCycleCounting*) [clone .extracted.68] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 1.07 | NA | NA | 0.78 | NA | NA | 52 | NA | NA | 103.31 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.05 |
L__Z14spread_on_gridPK9gmx_pme_tP11PmeAtomCommPK10pmegrids_tbbPfbi_910__par_region0_2_2 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 1.05 | NA | NA | 0.57 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 0.06 | NA |
std::enable_if<((BondedKernelFlavor)0)==((BondedKernelFlavor)0), float>::type (anonymous namespace)::angles<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.53 | NA | 0.48 | 0.36 | NA | 0.35 | 52 | NA | 52 | 267.89 | NA | 272.91 | 0.13 | NA | 0.10 | 0.09 | NA | 0.07 |
mkl_dft_avx512_mg_rowbatch_plain_fwd_096_s | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.6 | 0.39 | NA | 0.33 | 0.28 | NA | 52 | 52 | NA | 860.85 | 991.72 | NA | 0.11 | 0.05 | NA | 0.06 | 0.04 |
_INTERNAL1bba7552::gmx::lincs_update_atoms_ind(_INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<int const>, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<_INTERNAL1bba7552::gmx::AtomPair const>, float, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<float const>, _INTERNAL1bba7552:... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.92 | NA | NA | 0.5 | NA | NA | 52 | NA | NA | 42.96 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 0.08 | NA |
gmx::csettle(gmx::SettleData const&, int, int, t_pbc const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<flo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0.92 | 0 | NA | 0.67 | 21 | NA | 52 | NA | NA | 183.16 | 0.00 | NA | 0.15 | 0.00 | NA | 0.11 |
_INTERNALae0e43be::calc_interpolation_idx(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, int, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.9 | NA | NA | 0.49 | NA | NA | 52 | NA | NA | 62.86 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 0.06 | NA |
gmx::lincs_update_atoms_ind(gmx::ArrayRef<int const>, gmx::ArrayRef<gmx::AtomPair const>, float, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<float const>, float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.88 | NA | NA | 0.64 | NA | NA | 52 | NA | NA | 48.89 | NA | NA | 0.16 | NA | NA | 0.11 |
gmx::do_lincs(gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, float const (*) [3], t_pbc*, gmx::Lincs*, int, gmx::ArrayRef<float const>, t_commrec const*, bool, floa... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.87 | NA | NA | 0.64 | NA | NA | 52 | NA | NA | 76.89 | NA | NA | 0.11 | NA | NA | 0.08 |
gmx::lincs_update_atoms_ind(gmx::ArrayRef<int const>, gmx::ArrayRef<gmx::AtomPair const>, float, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<float const>, float (*) [3]) [clone... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.8 | NA | NA | 0.55 | NA | NA | 52 | NA | NA | 62.55 | NA | NA | 0.21 | NA | NA | 0.14 | NA | NA |
void gmx::settleTemplate<gmx::SimdFloat, gmx::SimdFBool, 16, float const*, true, false>(gmx::SettleData const&, int, int, float const*, float const*, float*, float, float*, float (*) [3], bool*) [clone .constprop.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.8 | NA | NA | 0.55 | NA | NA | 52 | NA | NA | 207.71 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 0.08 | NA | NA |
spread_on_grid(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, pmegrids_t const*, bool, bool, float*, bool, int) [clone .extracted.18] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.79 | NA | NA | 0.58 | NA | NA | 52 | NA | NA | 47.60 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.06 |
spread_on_grid(gmx_pme_t const*, PmeAtomComm*, pmegrids_t const*, bool, bool, float*, bool, int) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.79 | NA | NA | 0.55 | NA | NA | 52 | NA | NA | 51.00 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.05 | NA | NA |
std::enable_if<((BondedKernelFlavor)0)==((BondedKernelFlavor)0), float>::type (anonymous namespace)::pdihs<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*,... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.32 | NA | 0.45 | 0.22 | NA | 0.33 | 52 | NA | 52 | 463.82 | NA | 568.85 | 0.07 | NA | 0.08 | 0.05 | NA | 0.06 |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::clearForcesAndEnergies() | libgromacs_mpi.so.7 | 0.4 | NA | 0.36 | 0.28 | NA | 0.27 | 52 | NA | 52 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.19 | NA | 0.12 | 0.13 | NA | 0.09 |
gmx::do_lincs(gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, float const (*) [3], t_pbc*, gmx::Lincs*, int, gmx::ArrayRef<float const>, t_commrec const*, bool, floa... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.75 | NA | NA | 0.52 | NA | NA | 52 | NA | NA | 109.04 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 0.10 | NA | NA |
__intel_skx_avx512_memset | gmx_mpi | NA | 0.72 | NA | NA | 0.4 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.17 | NA | NA | 0.09 | NA |
__intel_avx_rep_memcpy | gmx_mpi | NA | NA | 0.66 | NA | NA | 0.48 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.13 | NA | NA | 0.09 |
fftwf_codelet_t1bv_32_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.65 | NA | NA | 0.45 | NA | NA | 52 | NA | NA | 282.31 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 0.08 | NA | NA |
_INTERNALb293ce76::makeClusterListSimd2xnn(Nbnxm::Grid const&, NbnxnPairlistCpu*, int, int, int, bool, float const*, float, float, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.63 | NA | NA | 0.34 | NA | NA | 52 | NA | NA | 239.68 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.03 | NA |
void gmx::(anonymous namespace)::reduceThreadForceBuffers<float [4]>(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<std::unique_ptr<gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>, std::default_delete<gmx::ThreadForceBuffer<fl... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.61 | NA | NA | 0.42 | NA | NA | 52 | NA | NA | 28.19 | NA | NA | 0.13 | NA | NA | 0.09 | NA | NA |
fftwf_codelet_t2sv_16_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.6 | NA | NA | 0.42 | NA | NA | 52 | NA | NA | 215.52 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.05 | NA | NA |
makeClusterListSimd2xnn(Nbnxm::Grid const&, NbnxnPairlistCpu*, int, int, int, bool, float const*, float, float, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.57 | NA | NA | 0.39 | NA | NA | 52 | NA | NA | 208.36 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
PairlistSet::constructPairlists(gmx::InteractionLocality, Nbnxm::GridSet const&, gmx::ArrayRef<PairsearchWork>, nbnxn_atomdata_t*, gmx::ListOfLists<int> const&, int, t_nrnb*, SearchCycleCounting*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.57 | NA | NA | 0.4 | NA | NA | 52 | NA | NA | 12.73 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
void gmx::(anonymous namespace)::reduceThreadForceBuffers<float [4]>(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<std::unique_ptr<gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>, std::default_delete<gmx::ThreadForceBuffer<fl... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.56 | NA | NA | 0.41 | NA | NA | 52 | NA | NA | 28.07 | NA | NA | 0.11 | NA | NA | 0.08 |
void _INTERNAL4f3e572d::gmx::__regcall3__gatherLoadUTranspose<3, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat*, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat*>(float const*, int const*, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat*, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat*, _INTERNAL4f3e57... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.56 | NA | NA | 0.3 | NA | NA | 52 | NA | NA | 1.60 | NA | NA | 0.14 | NA | NA | 0.07 | NA |
copy_rvec_to_nbat_real(int const*, int, int, float const (*) [3], int, float*, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.27 | NA | 0.27 | 0.19 | NA | 0.19 | 38 | NA | 39 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.17 | NA | 0.13 | 0.11 | NA | 0.10 |
void _INTERNALb293ce76::nbnxn_make_pairlist_part<NbnxnPairlistCpu>(Nbnxm::GridSet const&, Nbnxm::Grid const&, Nbnxm::Grid const&, PairsearchWork*, nbnxn_atomdata_t const*, gmx::ListOfLists<int> const&, float, PairlistType, int, ... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.53 | NA | NA | 0.29 | NA | NA | 52 | NA | NA | 22.00 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA |
gmx::Update::Impl::update_coords(t_inputrec const&, long, int, bool, gmx::ArrayRef<ParticleType const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const [3]>, t_state*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> co... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.52 | NA | NA | 0.38 | NA | NA | 52 | NA | NA | 70.74 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.05 |
nbnxn_kernel_prune_2xnn(NbnxnPairlistCpu*, nbnxn_atomdata_t const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.52 | NA | NA | 0.29 | NA | NA | 52 | NA | NA | 1991.18 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA |
L__ZN17_INTERNALd056bbd43gmx12_GLOBAL__N_124reduceThreadForceBuffersIA4_fEEvNS0_8ArrayRefINS0_11BasicVectorIfEEEENS4_ISt10unique_ptrINS0_17ThreadForceBufferIT_EESt14default_deleteISB_EEEENS4_IKSt5arrayImLm2EEEENS4_IKiEE_170__par_region0_2_127 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.51 | NA | NA | 0.28 | NA | NA | 52 | NA | NA | 27.25 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 0.05 | NA |
gmx::Update::Impl::update_coords(t_inputrec const&, long, int, bool, gmx::ArrayRef<ParticleType const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const [3]>, t_state*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> co... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.5 | NA | NA | 0.35 | NA | NA | 52 | NA | NA | 75.63 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.05 | NA | NA |
__nss_database_lookup | libc.so.6 | 0.49 | 0 | 0.01 | 0.34 | 0 | 0.01 | 52 | 1 | 2 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.19 | 0.00 | 0.30 | 0.13 | 0.00 | 0.22 |
std::enable_if<std::is_same<float [3], float [3]>::value||std::is_same<float [3], float const [3]>::value, void>::type _INTERNAL568e5334::updateMDLeapfrogSimpleSimd<(StoreUpdatedVelocities)0, float [3]>(int, int, float, gmx::ArrayRe... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.47 | NA | NA | 0.26 | NA | NA | 52 | NA | NA | 86.15 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.04 | NA |
__intel_skx_avx512_memcpy | gmx_mpi | NA | 0.46 | NA | NA | 0.25 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.13 | NA | NA | 0.07 | NA |
fftwf_codelet_t1fv_32_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.43 | NA | NA | 0.3 | NA | NA | 52 | NA | NA | 465.33 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.06 | NA | NA |
L__Z14spread_on_gridPK9gmx_pme_tP11PmeAtomCommPK10pmegrids_tbbPfbi_1010__par_region4_2_4 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.43 | NA | NA | 0.24 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA |
__intel_avx_rep_memset | gmx_mpi | NA | NA | 0.43 | NA | NA | 0.31 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 0.09 |
_INTERNAL8eaaea23::__kmp_hyper_barrier_release(barrier_type, kmp_info*, int, int, int, void*) | libiomp5.so | 0.12 | 0.15 | 0.15 | 0.08 | 0.08 | 0.11 | 49 | 52 | 52 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.22 | 0.18 | 0.21 | 0.15 | 0.10 | 0.15 |
fftwf_codelet_hc2cfdftv_12_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.41 | NA | NA | 0.28 | NA | NA | 52 | NA | NA | 308.54 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
pbc_dx_aiuc(t_pbc const*, float const*, float const*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.21 | NA | 0.19 | 0.14 | NA | 0.14 | 52 | NA | 52 | 74.50 | NA | 74.36 | 0.06 | NA | 0.04 | 0.04 | NA | 0.03 |
do_pairs(int, int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const*, float*, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<bool>, gmx::ArrayRef<unsigned short>, ... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.34 | NA | 0.04 | 0.23 | NA | 0.03 | 52 | NA | 52 | 181.87 | NA | 127.67 | 0.06 | NA | 0.02 | 0.04 | NA | 0.01 |
mkl_dft_avx512_ipps_cFFTinv_64_32fc | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.2 | 0.18 | NA | 0.11 | 0.14 | NA | 52 | 52 | NA | 1067.64 | 869.72 | NA | 0.05 | 0.04 | NA | 0.02 | 0.03 |
_INTERNAL1bba7552::gmx::do_lincs(_INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRefWithPadding<_INTERNAL1bba7552::gmx::BasicVector<float> const>, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRefWithPadding<_INTERNAL1bba7552::gmx::BasicVector<float> >, float const (*... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.35 | NA | NA | 0.19 | NA | NA | 52 | NA | NA | 66.63 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.04 | NA |
gmx::Update::Impl::finish_update(t_inputrec const&, bool, int, gmx::ArrayRef<unsigned short const>, t_state*, gmx_wallcycle*, bool) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.33 | NA | NA | 0.23 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
fftwf_rdft2_solve | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.33 | NA | NA | 0.23 | NA | NA | 52 | NA | NA | 71.61 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
solve_pme_yzx(gmx_pme_t const*, t_complex*, float, bool, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.32 | NA | NA | 0.18 | NA | NA | 52 | NA | NA | 829.95 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.02 | NA |
L__ZN3gmx6Update4Impl13finish_updateERK10t_inputrecbiNS_8ArrayRefIKtEEP7t_stateP13gmx_wallcycleb_1637__par_region0_2_148 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.32 | NA | NA | 0.18 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA |
(anonymous namespace)::dih_angle_simd(float const (*) [3], int const*, int const*, int const*, int const*, float const*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*,... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.32 | NA | NA | 0.22 | NA | NA | 52 | NA | NA | 519.27 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::__regcall3__calc_dr_x_xp_simd(int, int, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<_INTERNAL1bba7552::gmx::AtomPair const>, float const (*) [3], float const (*) [3], float const*, float const*, float const*, float (*) [3], float*, floa... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.31 | NA | NA | 0.17 | NA | NA | 52 | NA | NA | 160.94 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.04 | NA |
fftwf_codelet_n2fv_32_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.31 | NA | NA | 0.21 | NA | NA | 52 | NA | NA | 501.33 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA |
gmx::Update::Impl::finish_update(t_inputrec const&, bool, int, gmx::ArrayRef<unsigned short const>, t_state*, gmx_wallcycle*, bool) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.31 | NA | NA | 0.23 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 |
copy_rvec_to_nbat_real(int const*, int, int, float const (*) [3], int, float*, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.3 | NA | NA | 0.17 | NA | NA | 38 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.16 | NA | NA | 0.09 | NA |
DftiComputeBackward | libmkl_intel_lp64.so.2 | NA | 0.19 | 0.1 | NA | 0.1 | 0.08 | NA | 52 | 52 | NA | 172.00 | 347.00 | NA | 0.05 | 0.04 | NA | 0.02 | 0.03 |
fftwf_codelet_n1bv_64_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.29 | NA | NA | 0.2 | NA | NA | 52 | NA | NA | 574.40 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA |
void _INTERNAL5738f0d5::do_pairs_simple<gmx::SimdFloat, 16, float const*>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float const*, gmx::ArrayRef<float>, float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.29 | NA | NA | 0.16 | NA | NA | 52 | NA | NA | 184.63 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA |
void _INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__gatherLoadBySimdIntTranspose<3, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat*, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat*>(float const*, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFInt32, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat*, _INTERNALc075c6e4::... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.28 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 0.05 | NA |
void do_pairs_simple<gmx::SimdFloat, 16, float const*>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float const*, gmx::ArrayRef<float>, float) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.27 | NA | NA | 0.2 | NA | NA | 52 | NA | NA | 204.35 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.04 |
void _INTERNAL4f3e572d::gmx::__regcall3__transposeScatterStoreU<3>(float*, int const*, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.26 | NA | NA | 0.14 | NA | NA | 52 | NA | NA | 196.57 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA |
_INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::dih_angle_simd(float const (*) [3], int const*, int const*, int const*, int const*, float const*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat*, gmx::SimdFloat... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.25 | NA | NA | 0.14 | NA | NA | 52 | NA | NA | 472.00 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::__regcall3__do_dih_fup_noshiftf_simd(int const*, int const*, int const*, int const*, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, gmx::SimdFloat, f... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.23 | NA | NA | 0.13 | NA | NA | 52 | NA | NA | 110.46 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA |
pbc_dx_aiuc(t_pbc const*, float const*, float const*, float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.23 | NA | NA | 0.13 | NA | NA | 52 | NA | NA | 41.46 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA |
std::enable_if<((BondedKernelFlavor)0)==((BondedKernelFlavor)0), float>::type _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::angles<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc co... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.22 | NA | NA | 0.12 | NA | NA | 52 | NA | NA | 532.00 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA |
fftwf_codelet_n1bv_11_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.21 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 52 | NA | NA | 381.80 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA |
DftiComputeForward | libmkl_intel_lp64.so.2 | NA | 0.13 | 0.07 | NA | 0.07 | 0.05 | NA | 52 | 52 | NA | 309.71 | 449.60 | NA | 0.05 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.01 |
unwrap_periodic_pmegrid(gmx_pme_t*, float*) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.2 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.05 |
void _INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__transposeScatterIncrU<4>(float*, int const*, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.19 | NA | NA | 0.1 | NA | NA | 52 | NA | NA | 364.00 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALa817b2b7::nbnxn_atomdata_add_nbat_f_to_f_part(Nbnxm::GridSet const&, nbnxn_atomdata_t const&, nbnxn_atomdata_output_t const&, int, int, float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.19 | NA | NA | 0.11 | NA | NA | 52 | NA | NA | 38.55 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
mkl_dft_avx512_owns_cCcsRecombine_32f | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.12 | 0.07 | NA | 0.06 | 0.05 | NA | 52 | 52 | NA | 832.00 | 759.20 | NA | 0.03 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.02 |
evaluate_single(float, float, float const*, float, float, float, float, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.1 | NA | 0.08 | 0.07 | NA | 0.06 | 52 | NA | 52 | 41.57 | NA | 41.17 | 0.03 | NA | 0.03 | 0.02 | NA | 0.02 |
float _INTERNAL5738f0d5::do_pairs_general<(BondedKernelFlavor)2>(int, int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const*, float*, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>, gm... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.17 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 52 | NA | NA | 65.56 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
std::enable_if<((BondedKernelFlavor)0)==((BondedKernelFlavor)0), float>::type _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::pdihs<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc con... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.16 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 52 | NA | NA | 174.67 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALf8156861::gmx::SimdFloat _INTERNALf8156861::gmx::__regcall3__exp<(MathOptimization)0>(_INTERNALf8156861::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.16 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 52 | NA | NA | 1734.00 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
std::enable_if<(((BondedKernelFlavor)2)!=((BondedKernelFlavor)0))||(!(1)), float>::type _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::pdihs<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3],... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.16 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 52 | NA | NA | 72.44 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA |
mkl_dft_avx512_ippsFFTFwd_RToPerm_32f | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.1 | 0.05 | NA | 0.06 | 0.04 | NA | 52 | 52 | NA | 146.67 | 292.25 | NA | 0.06 | 0.03 | NA | 0.03 | 0.02 |
std::enable_if<(((BondedKernelFlavor)2)!=((BondedKernelFlavor)0))||(!(1)), float>::type (anonymous namespace)::angles<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, flo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.08 | NA | 0.07 | 0.06 | NA | 0.05 | 52 | NA | 52 | 111.67 | NA | 195.60 | 0.03 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 0.02 |
_ZN12_GLOBAL__N_124do_dih_fup_noshiftf_simdEPKiS1_S1_S1_N3gmx9SimdFloatES3_S3_S3_S3_S3_S3_S3_PA4_f@@608 | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.15 | NA | NA | 0.11 | NA | NA | 52 | NA | NA | 376.73 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.03 |
_INTERNAL1bba7552::gmx::__regcall3__calc_dist_iter_simd(int, int, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<_INTERNAL1bba7552::gmx::AtomPair const>, float const (*) [3], float const*, float const*, float const*, float, float*, float*, bool*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.14 | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 52 | NA | NA | 192.00 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA |
reduceForces(nbnxn_atomdata_t*, gmx::AtomLocality, Nbnxm::GridSet const&, float (*) [3]) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.14 | NA | NA | 0.1 | NA | NA | 52 | NA | NA | 44.10 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
reduceForces(nbnxn_atomdata_t*, gmx::AtomLocality, Nbnxm::GridSet const&, float (*) [3]) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.14 | NA | NA | 0.1 | NA | NA | 52 | NA | NA | 43.30 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 |
atanf | libm.so.6 | 0.13 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 52 | NA | NA | 16.11 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA |
compute_mg_row_bwd | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.09 | 0.04 | NA | 0.05 | 0.03 | NA | 52 | 52 | NA | 230.40 | 112.00 | NA | 0.03 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
unwrap_periodic_pmegrid(gmx_pme_t*, float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.13 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
fftwf_transpose | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.13 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 52 | NA | NA | 633.89 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
unwrap_periodic_pmegrid(gmx_pme_t*, float*) [clone ._omp_fn.1] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.13 | NA | NA | 0.09 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA |
void _INTERNAL4f3e572d::gmx::settleTemplate<_INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFBool, 16, float const*, true, false>(_INTERNAL4f3e572d::gmx::SettleData const&, int, int, float const*, float const*, float*, float, float... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.12 | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 52 | NA | NA | 1106.29 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
dih_angle(float const*, float const*, float const*, float const*, t_pbc const*, float*, float*, float*, float*, float*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.06 | NA | 0.06 | 0.04 | NA | 0.04 | 52 | NA | 52 | 101.50 | NA | 87.50 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 0.02 |
unknown_kernel_region | kernel | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 52 | 49 | 52 | 5.33 | 0.00 | 6.67 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.02 |
kmp_flag_native<unsigned long long, (flag_type)1, true>::done_check() | libiomp5.so | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 31 | 19 | 31 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.08 | 0.09 | 0.08 | 0.05 | 0.05 | 0.06 |
L__ZN17_INTERNAL727fa8dd19calc_ke_part_normalEN3gmx8ArrayRefIKNS0_11BasicVectorIfEEEEPK9t_grpoptsPK9t_mdatomsP14gmx_ekindata_tP6t_nrnbb_113__par_region0_2_11 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.11 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 52 | NA | NA | 121.67 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
__libm_atan2f_l9 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.1 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 52 | NA | NA | 47.83 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
L__ZN17_INTERNALc686538717setupForceOutputsEP18ForceHelperBuffersN3gmx19ArrayRefWithPaddingINS2_11BasicVectorIfEEEERKNS2_22DomainLifetimeWorkloadERKNS2_12StepWorkloadEbP13gmx_wallcycle_473__par_region0_2_126 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.1 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
__libm_sse2_sincosf | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.1 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 69.40 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
__kmp_launch_thread | libiomp5.so | 0.04 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 50 | 49 | 48 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 |
std::enable_if<(((BondedKernelFlavor)2)!=((BondedKernelFlavor)0))||(!(1)), float>::type _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::angles<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3]... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.09 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 125.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALb293ce76::setExclusionsForIEntry(Nbnxm::GridSet const&, NbnxnPairlistCpu*, bool, int, nbnxn_ci_t const&, gmx::ListOfLists<int> const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.09 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.40 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
bond_angle(float const*, float const*, float const*, t_pbc const*, float*, float*, float*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.05 | NA | 0.04 | 0.04 | NA | 0.03 | 52 | NA | 52 | 44.75 | NA | 68.33 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 0.01 |
void gmx::settleTemplate<gmx::SimdFloat, gmx::SimdFBool, 16, float const*, true, true>(gmx::SettleData const&, int, int, float const*, float const*, float*, float, float*, float (*) [3], bool*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.09 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 52 | NA | NA | 277.33 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
std::enable_if<(((BondedKernelFlavor)2)!=((BondedKernelFlavor)0))||(!(1)), float>::type (anonymous namespace)::pdihs<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, floa... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.03 | NA | 0.06 | 0.02 | NA | 0.04 | 52 | NA | 52 | 30.00 | NA | 38.25 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 0.02 |
compute_mg_row_fwd | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.05 | 0.03 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 52 | 52 | NA | 160.00 | 240.00 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
__kmp_init_implicit_task | libiomp5.so | 0.01 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 34 | 49 | 48 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 |
_INTERNAL051658ea::atoms_to_settles(gmx_domdec_t*, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<std::vector<int, std::allocator<int> > const>, int, int, InteractionList*, std::vector<int, std::allocator<int&... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.08 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
void do_dih_fup<(BondedKernelFlavor)2>(int, int, int, int, float, float*, float*, float*, float*, float*, float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const (*) [3], int, int, int) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.08 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 66.40 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
__acosf_finite | libm.so.6 | 0.08 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 35.40 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
calc_ke_part_normal(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_grpopts const*, t_mdatoms const*, gmx_ekindata_t*, t_nrnb*, bool) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.08 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 152.20 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
__libm_atan2f_l9 | gmx_mpi | NA | NA | 0.08 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 52 | NA | NA | 41.83 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 |
_INTERNAL568e5334::do_update_md(int, int, float, long, float const (*) [3], float (*) [3], float (*) [3], float const (*) [3], TemperatureCoupling, PressureCoupling, int, int, gmx::ArrayRef<unsigned short const>, bool, gmx::ArrayRef<unsigned short... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.08 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 69.50 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
std::enable_if<((BondedKernelFlavor)0)==((BondedKernelFlavor)0), float>::type (anonymous namespace)::rbdihs<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.03 | NA | 0.05 | 0.02 | NA | 0.04 | 37 | NA | 33 | 392.00 | NA | 285.00 | 0.04 | NA | 0.07 | 0.03 | NA | 0.05 |
fftwf_codelet_hc2cfdft_2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.07 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 10.60 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
f64xsubf128 | libm.so.6 | 0.07 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 47.00 | NA | NA | 0.10 | NA | NA | 0.07 | NA | NA |
__kmp_barrier | libiomp5.so | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 50 | 49 | 46 | 0.00 | 1.00 | 0.00 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 |
clearRVecs(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, bool) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.07 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
__libm_sincosf_e7 | gmx_mpi | NA | NA | 0.07 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 43.60 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 |
_INTERNALb293ce76::closeIEntry(NbnxnPairlistCpu*, int, bool, float, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.25 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
dih_angle(float const*, float const*, float const*, float const*, t_pbc const*, float*, float*, float*, float*, float*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 73.50 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
mkl_dft_avx512_ippsFFTInv_CCSToR_32f | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.04 | 0.03 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 51 | 51 | NA | 320.00 | 440.00 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
gmx_fft_1d(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 892.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
bond_angle(float const*, float const*, float const*, t_pbc const*, float*, float*, float*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 47.75 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__atan(_INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.07 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 680.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
gmx_fft_1d(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.06 | 0.01 | NA | 0.05 | 34 | NA | 52 | 0.00 | NA | 734.40 | 0.01 | NA | 0.03 | 0.00 | NA | 0.02 |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::clearForcesAndEnergies() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__sincos(_INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat*, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 1978.67 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
_INTERNALb293ce76::setBufferFlags(NbnxnPairlistCpu const&, int, int, std::array<unsigned long, 2ul>*, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 22.67 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
fftwf_codelet_hf_32 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 37.50 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
void _INTERNAL5738f0d5::gmx::__regcall3__transposeScatterDecrU<4>(float*, int const*, _INTERNAL5738f0d5::gmx::SimdFloat, _INTERNAL5738f0d5::gmx::SimdFloat, _INTERNAL5738f0d5::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 69.33 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
void _INTERNAL5738f0d5::gmx::__regcall3__transposeScatterIncrU<4>(float*, int const*, _INTERNAL5738f0d5::gmx::SimdFloat, _INTERNAL5738f0d5::gmx::SimdFloat, _INTERNAL5738f0d5::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.06 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 305.33 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
fftwf_rdft_solve | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 52 | NA | NA | 91.25 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
dd_make_local_constraints(gmx_domdec_t*, int, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::Constraints*, int, gmx::ArrayRef<InteractionList>) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 |
__kmp_join_barrier(int) | libiomp5.so | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 49 | 46 | 52 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 |
void do_dih_fup<(BondedKernelFlavor)2>(int, int, int, int, float, float*, float*, float*, float*, float*, float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const (*) [3], int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 52 | NA | NA | 89.20 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 |
void _INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__transposeScatterDecrU<4>(float*, int const*, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat, _INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 122.67 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
int _INTERNAL80d859f8::assignInteractionsForAtom<true>(AtomIndexSet const&, reverse_ilist_t const&, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, bool, int const*, bool, float, t_pbc const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 49 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
Unknown function | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 181.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.01 | NA |
mkl_dft_avx512_ippsDFTFwd_RToCCS_32f | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.03 | 0.02 | NA | 0.01 | 0.02 | NA | 51 | 52 | NA | 656.00 | 264.00 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
void _INTERNAL80d859f8::make_exclusions_zone<true>(gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, std::vector<gmx_moltype_t, std::allocator<gmx_moltype_t> &g... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
mkl_serv_verbose_mode | libmkl_core.so.2 | NA | 0.03 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 50 | 51 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
dd_make_local_constraints(gmx_domdec_t*, int, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::Constraints*, int, gmx::ArrayRef<InteractionList>) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 51 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
fftwf_codelet_hb_32 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.05 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 222.33 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
mkl_dft_avx512_ippsDFTInv_CCSToR_32f | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.03 | 0.02 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 50 | 50 | NA | 128.00 | 96.00 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
int assignInteractionsForAtom<true>(AtomIndexSet const&, reverse_ilist_t const&, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, bool, int const*, bool, float, t_pbc const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, Int... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
compute_1d_small_fwd | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 50 | 52 | NA | 576.00 | 688.00 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
compute_1d_small_bwd | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.02 | 0.02 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 51 | 52 | NA | 880.00 | 736.00 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 |
__libm_acosf_l9 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 51 | NA | NA | 19.50 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
float (anonymous namespace)::dopdihs<(BondedKernelFlavor)2>(float, float, float, float, int, float, float, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 36.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
calc_x_times_f(int, float const (*) [3], float const (*) [3], bool, float const (*) [3], float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 85.33 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
copy_fftgrid_to_pmegrid(gmx_pme_t*, float const*, float*, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
rebalanceSimpleLists(gmx::ArrayRef<NbnxnPairlistCpu const>, gmx::ArrayRef<NbnxnPairlistCpu>, gmx::ArrayRef<PairsearchWork>) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 51 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
_INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__asin(_INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 704.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
_Z8calc_viriPA3_KfS1_PA3_fbS1#omp_region_0 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 124.50 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNAL6f8e2c7b::divide_bondeds_over_threads(bonded_threading_t*, bool, InteractionDefinitions const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmp_invoke_task_func | libiomp5.so | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 33 | 42 | 39 | 0.00 | 1.00 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.01 | 0.01 |
Unknown function | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.03 | 0.01 | NA | 0.02 | 38 | NA | 52 | 43.00 | NA | 279.50 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 |
calc_ke_part_normal(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_grpopts const*, t_mdatoms const*, gmx_ekindata_t*, t_nrnb*, bool) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 251.67 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 |
rebalanceSimpleLists(gmx::ArrayRef<NbnxnPairlistCpu const>, gmx::ArrayRef<NbnxnPairlistCpu>, gmx::ArrayRef<PairsearchWork>) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 |
sum_forces(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 48.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
__libm_acosf_l9 | gmx_mpi | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 5.50 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
fftwf_dft_solve | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 490.50 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
unwrap_periodic_pmegrid(gmx_pme_t*, float*) [clone .extracted.30] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
void make_exclusions_zone<true>(gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, std::vector<gmx_moltype_t, std::allocator<gmx_moltype_t> > const&, gmx:... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
atoms2md(gmx_mtop_t const&, t_inputrec const&, int, gmx::ArrayRef<int>, int, gmx::MDAtoms*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 51 | NA | NA | 0.50 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNAL4f3e572d::__regcall3__pbc_dx_aiuc(float const*, gmx::SimdFloat const*, gmx::SimdFloat const*, gmx::SimdFloat*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 51 | NA | NA | 640.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
void _INTERNALb293ce76::copySelectedListRange<false>(nbnxn_ci_t const*, NbnxnPairlistCpu const*, NbnxnPairlistCpu*, std::array<unsigned long, 2ul>*, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 47 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNALc6865387::postProcessForces(t_commrec const*, long, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ForceOutputs*, float (*) [3], t_mdatoms const*, t_forcerec const*, gmx::VirtualSitesHa... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 19.50 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
__kmp_invoke_microtask | libiomp5.so | 0 | 0.02 | 0.01 | 0 | 0.01 | 0.01 | 25 | 47 | 40 | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.01 | 0.01 |
_INTERNALc226143a::energyDrift(gmx::ArrayRef<VerletbufAtomtype const>, gmx_ffparams_t const*, float, pot_derivatives_t const*, pot_derivatives_t const*, pot_derivatives_t const*, float, float, float, float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 1 | NA | NA | 77.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_fft_1d_real(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 50 | NA | NA | 704.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
gmx_fft_many_1d(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 524.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
void make_exclusions_zone<true>(gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, std::vector<gmx_moltype_t, std::allocator<gmx_moltype_t> > const&, gmx:... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
sum_forces(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 50 | NA | NA | 38.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
float (anonymous namespace)::idihs<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*, gmx::ArrayRef<float const>, t_fcdata*, t_disresdata*, t_oriresdata*, in... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 0.01 | 27 | NA | 31 | 50.00 | NA | 92.00 | 0.02 | NA | 0.03 | 0.01 | NA | 0.02 |
unwrap_periodic_pmegrid(gmx_pme_t*, float*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 50 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
_INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat _INTERNALc075c6e4::gmx::__regcall3__sqrt<(MathOptimization)0>(_INTERNALc075c6e4::gmx::SimdFloat) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.03 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 52 | NA | NA | 1600.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
__kmp_finish_implicit_task | libiomp5.so | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0 | 0.01 | 34 | 29 | 41 | 0.00 | NA | 16.00 | 0.01 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.01 |
__sched_yield | libc.so.6 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0 | 0.01 | 40 | 24 | 43 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.01 |
std::vector<int, std::allocator<int> >::_M_default_append(unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.02 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 34 | NA | 32 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.02 | NA | 0.02 | 0.01 | NA | 0.01 |
std::enable_if<((BondedKernelFlavor)0)==((BondedKernelFlavor)0), float>::type _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::rbdihs<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc co... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 30 | NA | NA | 124.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
L__ZN17_INTERNAL1bba75523gmx18lincs_thread_setupEPNS0_5LincsEi_1695__par_region2_2_84 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 45 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNAL5ce61142::Nbnxm::sort_atoms(int, bool, int, bool, int*, int, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float, float, int, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 35 | NA | NA | 4.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
Nbnxm::Grid::fillCell(Nbnxm::GridSetData*, nbnxn_atomdata_t*, int, int, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, Nbnxm::BoundingBox*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 32 | NA | 31 | 6.00 | NA | 0.00 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 |
mkl_dft_avx512_transfer_ipp_mkl_error | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0 | 0 | NA | 47 | 42 | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 |
std::vector<std::array<unsigned long, 2ul>, std::allocator<std::array<unsigned long, 2ul> > >::_M_fill_insert(__gnu_cxx::__normal_iterator<std::array<unsigned long, 2ul>*, std::vector<std::array<unsigned long, 2ul>... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 41 | NA | 39 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.00 |
globalAtomIndexToMoltypeIndices(gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0 | 25 | NA | 29 | NA | NA | NA | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
std::enable_if<(((BondedKernelFlavor)2)!=((BondedKernelFlavor)0))||(!(1)), float>::type (anonymous namespace)::rbdihs<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, flo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0.01 | 21 | NA | 27 | NA | NA | 61.00 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 |
__kmpc_barrier | libiomp5.so | 0 | 0.01 | 0.01 | 0 | 0.01 | 0 | 28 | 37 | 32 | NA | 32.00 | NA | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::resizeBufferAndClearMask(int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0 | 27 | NA | 30 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx::dd_partition_system(_IO_FILE*, gmx::MDLogger const&, long, t_commrec const*, bool, int, t_state*, gmx_mtop_t const&, t_inputrec const&, gmx::ImdSession*, pull_t*, t_state*, gmx::ForceBuffers*, gmx::MDAtoms*, gmx_localtop_t*, t_forcerec*, g... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0.01 | 1 | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__kmp_yield | libiomp5.so | 0.01 | 0.01 | 0 | 0 | 0 | 0 | 25 | 24 | 27 | NA | NA | NA | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
gmx::ThreadedForceBuffer<float [4]>::setupReduction() | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 1 | NA | 1 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
void _INTERNALb293ce76::copySelectedListRange<true>(nbnxn_ci_t const*, NbnxnPairlistCpu const*, NbnxnPairlistCpu*, std::array<unsigned long, 2ul>*, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 38 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
__kmpc_for_static_init_4u | libiomp5.so | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 42 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
std::enable_if<(((BondedKernelFlavor)2)!=((BondedKernelFlavor)0))||(!(1)), float>::type _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::rbdihs<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3]... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 27 | NA | NA | 85.00 | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA |
float _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::idihs<(BondedKernelFlavor)0>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*, gmx::ArrayRef<float const>, t_fcdata*, t_disresdata*... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 29 | NA | NA | 102.00 | NA | NA | 0.04 | NA | NA | 0.02 | NA |
gmx::lincs_update_atoms(gmx::Lincs*, int, float, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<float const>, float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 43 | NA | 33 | 5.00 | NA | 5.00 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.01 |
quicksort | gmx_mpi | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 50 | NA | NA | 4.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
__kmpc_for_static_init_4 | libiomp5.so | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 48 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
calc_vir(int, float const (*) [3], float const (*) [3], float (*) [3], bool, float const (*) [3]) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 51 | NA | NA | 156.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
gmx_fft_1d_real(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0.02 | 0 | NA | 0.01 | 22 | NA | 51 | NA | NA | 672.00 | 0.00 | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.01 |
unwrap_periodic_pmegrid(gmx_pme_t*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 1 | NA | 1 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
calcBondedForces(InteractionDefinitions const&, bonded_threading_t*, float const (*) [3], t_forcerec const*, t_pbc const*, float (*) [3], gmx_enerdata_t*, t_nrnb*, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float>, t_mdatoms const*, t_fcdata... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 41 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
__kmpc_for_static_fini | libiomp5.so | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0 | 0 | NA | 28 | 32 | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 |
mkl_serv_verbose_mode@plt | libmkl_intel_lp64.so.2 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0 | 0 | NA | 30 | 36 | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
atoms2md(gmx_mtop_t const&, t_inputrec const&, int, gmx::ArrayRef<int>, int, gmx::MDAtoms*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 49 | NA | NA | 2.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
Nbnxm::sort_atoms(int, bool, int, bool, int*, int, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float, float, int, gmx::ArrayRef<int>) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 33 | NA | NA | 2.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
atoms2md(gmx_mtop_t const&, t_inputrec const&, int, gmx::ArrayRef<int>, int, gmx::MDAtoms*) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 51 | NA | NA | 3.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
int assignInteractionsForAtom<true>(AtomIndexSet const&, reverse_ilist_t const&, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, bool, int const*, bool, float, t_pbc const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, Int... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 44 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
calcBondedForces(InteractionDefinitions const&, bonded_threading_t*, float const (*) [3], t_forcerec const*, t_pbc const*, float (*) [3], gmx_enerdata_t*, t_nrnb*, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float>, t_mdatoms const*, t_fcdata... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 49 | NA | NA | 5.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
void _INTERNAL4f3e572d::gmx::settleTemplate<_INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFloat, _INTERNAL4f3e572d::gmx::SimdFBool, 16, float const*, true, true>(_INTERNAL4f3e572d::gmx::SettleData const&, int, int, float const*, float const*, float*, float, float*... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 50 | NA | NA | 720.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNAL01945b58::calcBondedForces(InteractionDefinitions const&, bonded_threading_t*, float const (*) [3], t_forcerec const*, t_pbc const*, float (*) [3], gmx_enerdata_t*, t_nrnb*, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float>, t_mdato... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 43 | NA | NA | 1.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
void _INTERNALb293ce76::get_cell_range<1>(float, float, Nbnxm::Grid::Dimensions const&, float, float, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 47 | NA | NA | 21.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
void __kmp_dispatch_deo<unsigned int>(int*, int*, ident*) | libiomp5.so | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 0.01 | 0.01 | NA | 51 | 41 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 |
__atan2f_finite | libm.so.6 | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 52 | NA | NA | 83.00 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
energyDriftAtomPair(bool, bool, float, float, float, float, pot_derivatives_t const*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 112.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx_fft_many_1d(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 52 | NA | NA | 944.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
fftwf_execute_dft | libfftw3f.so.3.6.10 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 37 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
nbnxn_atomdata_copy_x_to_nbat_x(Nbnxm::GridSet const&, gmx::AtomLocality, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_t*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 41 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::Constraints::Impl::apply(bool, bool, long, int, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, float const (*)... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 37 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
setup_bonded_threading(bonded_threading_t*, int, bool, InteractionDefinitions const&) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 44 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::lincs_thread_setup(gmx::Lincs*, int) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 38 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::set_lincs(InteractionDefinitions const&, int, gmx::ArrayRef<float const>, float, bool, t_commrec const*, gmx::Lincs*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 41 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
atan2f | libm.so.6 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 51 | NA | NA | 140.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
void get_cell_range<0>(float, float, Nbnxm::Grid::Dimensions const&, float, float, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 46 | NA | NA | 24.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
approx_2dof(float, float, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 58.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
void get_cell_range<1>(float, float, Nbnxm::Grid::Dimensions const&, float, float, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 46 | NA | NA | 22.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
divide_bondeds_over_threads(bonded_threading_t*, bool, InteractionDefinitions const&) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::constrain_lincs(bool, t_inputrec const&, long, gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVecto... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 39 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
erfcf | libm.so.6 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 76.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::set_lincs_matrix(gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, float) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 39 | NA | NA | 5.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
atoms_to_constraints(gmx_domdec_t*, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::ListOfLists<int> const>, int, InteractionList*, std::vector<int, std::allocator<int> >*) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
std::vector<std::array<unsigned long, 2ul>, std::allocator<std::array<unsigned long, 2ul> > >::_M_fill_insert(__gnu_cxx::__normal_iterator<std::array<unsigned long, 2ul>*, std::vector<std::array<unsigned long, 2ul>... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 35 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
Nbnxm::sort_atoms(int, bool, int, bool, int*, int, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float, float, int, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 34 | NA | NA | 1.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
_INTERNALb293ce76::reduce_buffer_flags(gmx::ArrayRef<PairsearchWork>, int, gmx::ArrayRef<std::array<unsigned long, 2ul> >) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
setup_bonded_threading(bonded_threading_t*, int, bool, InteractionDefinitions const&) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
void std::vector<int, std::allocator<int> >::_M_range_insert<gmx::ArrayRefIter<int const> >(__gnu_cxx::__normal_iterator<int*, std::vector<int, std::allocator<int> > >, gmx::ArrayRefIter<int const>, gmx::Arra... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 44 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
int make_bondeds_zone<true>(gmx_reverse_top_t const&, gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, std::vector<gmx_molblock_t, std::allocator<gmx_molblock_t> > const&, bool, int const*, bo... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 45 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
setup_bonded_threading(bonded_threading_t*, int, bool, InteractionDefinitions const&) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 40 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
_INTERNAL83cfe191::make_dd_indices(gmx_domdec_t*, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN3gmx11Constraints4Impl5applyEbblifNS_19ArrayRefWithPaddingINS_11BasicVectorIfEEEES5_NS_8ArrayRefIS4_EEPA3_KffPfS5_bPA3_fNS_18ConstraintVariableE_587__par_region0_2_174 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 25 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__libm_expf_l9 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_dl_deallocate_tls | ld-linux-x86-64.so.2 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 24 | 23 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
_INTERNALb293ce76::icell_set_x_simd_2xnn(int, float, float, float, int, float const*, NbnxnPairlistCpuWork*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 26 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
Nbnxm::Grid::calcColumnIndices(Nbnxm::Grid::Dimensions const&, gmx::UpdateGroupsCog const*, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, int, int const*, int, int, gmx::ArrayRef<int>, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 28 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmpc_for_static_init_8u | libiomp5.so | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 24 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::set_lincs_matrix(gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, float) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 44 | NA | NA | 9.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
gmx::set_lincs(InteractionDefinitions const&, int, gmx::ArrayRef<float const>, float, bool, t_commrec const*, gmx::Lincs*) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 38 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 |
_intel_fast_memcpy | gmx_mpi | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 28 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 |
gmx::lincs_thread_setup(gmx::Lincs*, int) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 26 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
gmx_pme_do(gmx_pme_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<flo... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 27 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
(anonymous namespace)::calc_one_bond(int, int, InteractionDefinitions const&, gmx::ArrayRef<int const>, int, WorkDivision const&, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_forcerec const*, t_pbc const*, gmx_grppairener_t*, t_nrnb*,... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 29 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
nbnxn_kernel_cpu(PairlistSet const&, Nbnxm::KernelSetup const&, nbnxn_atomdata_t*, interaction_const_t const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::StepWorkload const&, int, float*, float*, gmx_wallcycle*) [clone .... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 30 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::lincs_thread_setup(gmx::Lincs*, int) [clone .extracted.52] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 41 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
mm_account_ptr_by_tid | libmkl_core.so.2 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 46 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
atoms_to_constraints(gmx_domdec_t*, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::ListOfLists<int> const>, int, InteractionList*, std::vector<int, std::allocator<int> >*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__libm_exp_l9 | gmx_mpi | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 18.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
nbnxn_atomdata_copy_x_to_nbat_x(Nbnxm::GridSet const&, gmx::AtomLocality, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_t*) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 31 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 |
__libm_erfcf_ex | gmx_mpi | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 52.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
dd_redistribute_cg(_IO_FILE*, long, gmx_domdec_t*, int*, t_state*, t_forcerec*, t_nrnb*, int*) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 34 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 |
_INTERNALb293ce76::makeClusterListWrapper(NbnxnPairlistCpu*, Nbnxm::Grid const&, int, Nbnxm::Grid const&, int, int, bool, nbnxn_atomdata_t const*, float, float, ClusterDistanceKernelType, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 41 | NA | NA | 3.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
int _INTERNAL80d859f8::make_bondeds_zone<true>(gmx_reverse_top_t const&, gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, std::vector<gmx_molblock_t, std::allocator<gmx_molblock_t> > const&, b... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 24 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
set_pbc_simd(t_pbc const*, float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 24 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL051658ea::atoms_to_constraints(gmx_domdec_t*, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::ListOfLists<int> const>, int, InteractionList*, std::vector<int, std::allocator<int> >*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void _INTERNALb293ce76::get_cell_range<0>(float, float, Nbnxm::Grid::Dimensions const&, float, float, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 45 | NA | NA | 35.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::allocator_traits<gmx::Allocator<float, gmx::AlignedAllocationPolicy> >::_S_destroy<gmx::Allocator<float, gmx::AlignedAllocationPolicy>, float>(gmx::Allocator<float, gmx::AlignedAllocationPolicy>&, float*, ...) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
setup_bonded_threading(bonded_threading_t*, int, bool, InteractionDefinitions const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 33 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::vector<int, std::allocator<int> >::_M_range_insert<gmx::ArrayRefIter<int const> >(__gnu_cxx::__normal_iterator<int*, std::vector<int, std::allocator<int> > >, gmx::ArrayRefIter<int const>, gmx::Arra... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 38 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN3gmx15constrain_lincsEbRK10t_inputreclPNS_5LincsENS_8ArrayRefIKfEEPK9t_commrecPK14gmx_multisim_tNS_19ArrayRefWithPaddingIKNS_11BasicVectorIfEEEENSE_ISG_EENS5_ISG_EEPA3_S6_P5t_pbcbfPffSK_bPA3_fNS_18ConstraintVariableEP6t_nrnbiPi_2483__par_region0_2_21 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 37 | NA | NA | 1.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL5ce61142::Nbnxm::sort_cluster_on_flag(int, int, int, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<int>, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 31 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
L__Z31nbnxn_atomdata_copy_x_to_nbat_xRKN5Nbnxm7GridSetEN3gmx12AtomLocalityEPA3_KfP16nbnxn_atomdata_t_993__par_region0_2_45 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 39 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::set_matrix_indices(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs*, _INTERNAL1bba7552::gmx::Task const&, _INTERNAL1bba7552::gmx::ListOfLists<int> const&, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 37 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
__kmp_enter_single | libiomp5.so | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 40 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
Nbnxm::Grid::fillCell(Nbnxm::GridSetData*, nbnxn_atomdata_t*, int, int, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, Nbnxm::BoundingBox*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 32 | NA | NA | 208.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
gmx::ThreadedForceBuffer<float [4]>::setupReduction() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::lincs_update_atoms(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs*, int, float, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<float const>, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<_INTERNAL1bba7552::gmx::BasicVector<float> const>, _INTERNAL1bba7552::g... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 26 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
gmx_fft_many_1d_real(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 46 | NA | NA | 704.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
void _INTERNAL83cfe191::orderVector<gmx::BasicVector<float> >(gmx::ArrayRef<gmx_cgsort const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::resizeBufferAndClearMask(int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 27 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL80d859f8::atomInMolblockFromGlobalAtomnr(gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 35 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN17_INTERNAL53d1705a16nbnxn_kernel_cpuERK11PairlistSetRKN5Nbnxm11KernelSetupEP16nbnxn_atomdata_tRK19interaction_const_tN3gmx8ArrayRefIKNSC_11BasicVectorIfEEEERKNSC_12StepWorkloadEiPfSL_P13gmx_wallcycle_265__par_region0_2_20 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 28 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL3b86f157::calc_cg_move(_IO_FILE*, long, gmx_domdec_t*, t_state*, int const*, float (*) [3], float const*, float const*, MoveLimits const&, int, int, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 30 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
__libm_exp_l9 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL01945b58::(anonymous namespace)::calc_one_bond(int, int, InteractionDefinitions const&, gmx::ArrayRef<int const>, int, WorkDivision const&, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_forcerec const*, t_pbc const*, gmx_grppa... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 33 | NA | NA | 4.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::Update::Impl::update_coords(t_inputrec const&, long, int, bool, gmx::ArrayRef<ParticleType const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const [3]>, t_state*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> co... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 28 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
__intel_avx_memmove | gmx_mpi | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.28 | NA | NA | 0.15 | NA |
globalAtomIndexToMoltypeIndices(gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 32 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__Z10gmx_pme_doP9gmx_pme_tN3gmx8ArrayRefIKNS1_11BasicVectorIfEEEENS2_IS4_EENS2_IKfEES9_S9_S9_S9_S9_PA3_S8_PK9t_commreciiP6t_nrnbP13gmx_wallcyclePA3_fSK_PfSL_ffSL_SL_RKNS1_12StepWorkloadE_1401__par_region1_2_70 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 28 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
__libm_erfcf_ex | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::set_lincs_matrix_task(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs*, _INTERNAL1bba7552::gmx::Task*, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<float const>, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 31 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
energyDriftAtomPair(bool, bool, float, float, float, float, pot_derivatives_t const*) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 1 | NA | NA | 36.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
L__ZN17_INTERNALc686538717setupForceOutputsEP18ForceHelperBuffersN3gmx19ArrayRefWithPaddingINS2_11BasicVectorIfEEEERKNS2_22DomainLifetimeWorkloadERKNS2_12StepWorkloadEbP13gmx_wallcycle_473__par_region4_2_128 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 43 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmp_get_global_thread_id_reg | libiomp5.so | 0.01 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 30 | 9 | 6 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.00 |
nbnxn_kernel_cpu(PairlistSet const&, Nbnxm::KernelSetup const&, nbnxn_atomdata_t*, interaction_const_t const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::StepWorkload const&, int, float*, float*, gmx_wallcycle*) [clone .... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 35 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
void std::vector<int, std::allocator<int> >::_M_range_insert<gmx::ArrayRefIter<int const> >(__gnu_cxx::__normal_iterator<int*, std::vector<int, std::allocator<int> > >, gmx::ArrayRefIter<int const>, gmx::Arra... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 29 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::set_lincs(InteractionDefinitions const&, int, gmx::ArrayRef<float const>, float, bool, t_commrec const*, gmx::Lincs*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__kmp_fork_barrier(int, int) | libiomp5.so | 0 | 0.01 | 0 | 0 | 0 | 0 | 19 | 28 | 23 | NA | NA | NA | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
__kmp_wait_4 | libiomp5.so | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 24 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
atomInMolblockFromGlobalAtomnr(gmx::ArrayRef<MolblockIndices const>, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 33 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_pme_do(gmx_pme_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<flo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 30 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
void do_dih_fup<(BondedKernelFlavor)0>(int, int, int, int, float, float*, float*, float*, float*, float*, float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const (*) [3], int, int, int) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 25 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
gmx::lincs_thread_setup(gmx::Lincs*, int) [clone ._omp_fn.1] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 32 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
void orderVector<gmx::BasicVector<float> >(gmx::ArrayRef<gmx_cgsort const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
dd_redistribute_cg(_IO_FILE*, long, gmx_domdec_t*, int*, t_state*, t_forcerec*, t_nrnb*, int*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0.01 | NA | NA | 0 | NA | NA | 25 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_fft_many_1d_real(gmx_fft*, gmx_fft_direction, void*, void*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0.01 | 2 | NA | 49 | NA | NA | 960.00 | 0.00 | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.01 |
set_pbc_simd(t_pbc const*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0.01 | 24 | NA | 37 | NA | NA | 8.00 | 0.00 | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.00 |
Nbnxm::Grid::sortColumnsCpuGeometry(Nbnxm::GridSetData*, int, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, nbnxn_atomdata_t*, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0.01 | 0 | NA | 0 | 12 | NA | 28 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.00 |
__kmp_free_team | libiomp5.so | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::allocator_traits<gmx::Allocator<Nbnxm::BoundingBox, gmx::AlignedAllocationPolicy> >::_S_destroy<gmx::Allocator<Nbnxm::BoundingBox, gmx::AlignedAllocationPolicy>, Nbnxm::BoundingBox>(gmx::Allocator<Nbnxm::BoundingBox, gm... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::constrain_lincs(bool, t_inputrec const&, long, gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVecto... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
CpuPpLongRangeNonbondeds::calculate(gmx_pme_t*, t_commrec const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ForceWithVirial*, gmx_enerdata_t*, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::makeLincsDeviations(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs const&, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<_INTERNAL1bba7552::gmx::BasicVector<float> const>, t_pbc const*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
reset_enerdata(gmx_enerdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
calc_temp(float, float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ThreeFry2x64General<20u, 64u>::restart(unsigned long, unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALb7c28a0f::gmx::constr_recur(_INTERNALb7c28a0f::gmx::ListOfLists<int> const&, std::array<InteractionList, 94ul> const&, _INTERNALb7c28a0f::gmx::ArrayRef<t_iparams const>, bool, int, int, int, _INTERNALb7c28a0f::gmx::ArrayR... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
reduce_energies_over_lists(nbnxn_atomdata_t const*, int, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN17_INTERNAL1bba75523gmx16set_lincs_matrixEPNS0_5LincsENS0_8ArrayRefIKfEEf_1347__par_region0_2_50 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
mdoutf_get_tng_compressed_lambda_output_interval(gmx_mdoutf*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_get_stop_condition() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
do_force(_IO_FILE*, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, t_inputrec const&, gmx::Awh*, gmx_enfrot*, gmx::ImdSession*, pull_t*, long, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, gmx_localtop_t const*, float const (*) [3], gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector&l... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmpc_fork_call | libiomp5.so | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_t::x() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::allocator_traits<gmx::Allocator<gmx::BasicVector<float>, gmx::AlignedAllocationPolicy> >::_S_destroy<gmx::Allocator<gmx::BasicVector<float>, gmx::AlignedAllocationPolicy>, gmx::BasicVector<float> >(gmx::A... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
std::vector<nbnxn_ci_t, gmx::DefaultInitializationAllocator<nbnxn_ci_t, std::allocator<nbnxn_ci_t> > >::_M_default_append(unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_copy_x_to_nbat_x(Nbnxm::GridSet const&, gmx::AtomLocality, float const (*) [3], nbnxn_atomdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_copy_shiftvec(bool, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, nbnxn_atomdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::allocator_traits<gmx::Allocator<gmx::BasicVector<float>, gmx::HostAllocationPolicy> >::_S_destroy<gmx::Allocator<gmx::BasicVector<float>, gmx::HostAllocationPolicy>, gmx::BasicVector<float> >(gmx::Allocat... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_t::resizeCoordinateBuffer(int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::vector<nbnxn_cj_t, gmx::DefaultInitializationAllocator<nbnxn_cj_t, std::allocator<nbnxn_cj_t> > >::_M_realloc_insert<nbnxn_cj_t const&>(__gnu_cxx::__normal_iterator<nbnxn_cj_t*, std::vector<nbnxn_cj_t, gmx::Defau... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::Constraints::apply(bool, bool, long, int, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, float const (*) [3], ... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::CheckpointHandler::decideIfCheckpointingThisStepImpl(bool, bool, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
wallcycle_stop(gmx_wallcycle*, WallCycleCounter) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL3b86f157::getMovedBuffer(gmx_domdec_comm_t*, unsigned long, unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::log2I(unsigned int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
.plt.got@start | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 1 | 2 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
wallcycle_start(gmx_wallcycle*, WallCycleCounter) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__Z25dd_make_local_constraintsP12gmx_domdec_tiRK10gmx_mtop_tN3gmx8ArrayRefIKlEEPNS4_11ConstraintsEiNS5_I15InteractionListEE_458__par_region0_2_19 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
dd_move_x_specat(gmx_domdec_t const*, gmx_domdec_specat_comm_t*, float const (*) [3], float (*) [3], float (*) [3], bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALd01bd45b::distributeAtomGroups(gmx::MDLogger const&, gmx_domdec_t*, gmx_mtop_t const&, float const (*) [3], gmx_ddbox_t const*, float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmp_task_team_wait | libiomp5.so | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 1 | 1 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
gmx::do_constrain_first(_IO_FILE*, gmx::Constraints*, t_inputrec const*, int, int, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, float const (*) [3], float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nonbonded_verlet_t::atomdata_add_nbat_f_to_f(gmx::AtomLocality, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALbcb7f4c5::low_set_pbc(t_pbc*, PbcType, int const*, float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
EwaldBoxZScaler::scaleBox(float const (*) [3], float (*) [3]) const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
calc_vir(int, float const (*) [3], float const (*) [3], float (*) [3], bool, float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::CheckpointHandler::setSignalImpl(gmx_walltime_accounting*) const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
mk_mshift(_IO_FILE*, t_graph*, PbcType, float const (*) [3], float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::PaddedVector<gmx::BasicVector<float>, gmx::Allocator<gmx::BasicVector<float>, gmx::HostAllocationPolicy> >::arrayRefWithPadding() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
inflate_fast | libmpi.so.12.0.0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 1 | 1 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
nonbonded_verlet_t::convertCoordinates(gmx::AtomLocality, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_gettime() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
InteractionDefinitions::clear() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ImdSession::updateEnergyRecordAndSendPositionsAndEnergies(bool, long, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
fftwf_codelet_r2cfII_12 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
_INTERNALc6865387::setupStepWorkload(int, gmx::ArrayRef<gmx::MtsLevel const>, long, gmx::SimulationWorkload const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_pme_do(gmx_pme_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<flo... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::Update::Impl::update_sd_second_half(t_inputrec const&, long, float*, int, gmx::ArrayRef<ParticleType const>, gmx::ArrayRef<float const>, t_state*, t_commrec const*, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, gmx::Constraints*, bool, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
isMasterSim(gmx_multisim_t const*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
acosf | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doReal(float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::Update::Impl::finish_update(t_inputrec const&, bool, int, gmx::ArrayRef<unsigned short const>, t_state*, gmx_wallcycle*, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALc6865387::setupForceOutputs(ForceHelperBuffers*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::DomainLifetimeWorkload const&, gmx::StepWorkload const&, bool, gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
wallcycleBarrier(gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALc6865387::computeSpecialForces(_IO_FILE*, t_commrec const*, t_inputrec const&, gmx::Awh*, gmx_enfrot*, gmx::ImdSession*, pull_t*, long, double, gmx_wallcycle*, gmx::ForceProviders*, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<flo... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ImdSession::run(long, bool, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, double) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL727fa8dd::calc_ke_part_normal(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_grpopts const*, t_mdatoms const*, gmx_ekindata_t*, t_nrnb*, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::invertBoxMatrix(float const (*) [3], float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
Nbnxm::GridSet::setLocalAtomOrder() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN11PairlistSet18constructPairlistsEN3gmx19InteractionLocalityERKN5Nbnxm7GridSetENS0_8ArrayRefI14PairsearchWorkEEP16nbnxn_atomdata_tRKNS0_11ListOfListsIiEEiP6t_nrnbP19SearchCycleCounting_4092__par_region2_2_64 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 3 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmpc_single | libiomp5.so | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA |
__libm_exp_k32 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALa817b2b7::nbnxn_atomdata_set_atomtypes(nbnxn_atomdata_t::Params*, Nbnxm::GridSet const&, gmx::ArrayRef<int const>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
mkl_dft_avx512_owns_cRealRecombine_32f@plt | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 5 | 6 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 |
gmx::ArrayRef<float const>::ArrayRef<std::vector<float, gmx::Allocator<float, gmx::HostAllocationPolicy> > const&, void>(std::vector<float, gmx::Allocator<float, gmx::HostAllocationPolicy> > const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 3 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
calculateSimpleBond(int, int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*, gmx::ArrayRef<float const>, t_fcdata*, t_disresdata*, t_oriresdata*, int*, BondedKernelFlavor) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 3 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::SettleData::virfac() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 3 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
getThreadAtomRange(int, int, int, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 3 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_ga2la_t::clear(bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
dd_redistribute_cg(_IO_FILE*, long, gmx_domdec_t*, int*, t_state*, t_forcerec*, t_nrnb*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__libc_free | libc.so.6 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL80d859f8::combine_idef(InteractionDefinitions*, gmx::ArrayRef<thread_work_t const>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
dd_force_flop_stop(gmx_domdec_t*, t_nrnb*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
pmegrids_init(pmegrids_t*, int, int, int, int, int, bool, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
pme_run_mode(gmx_pme_t const*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
get_pme_ener_vir_q(pme_solve_work_t*, int, PmeOutput*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
do_per_step(long, long) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::CheckpointHandler::decideIfCheckpointingThisStep(bool, bool, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
ewald_charge_correction(t_commrec const*, float, float, gmx::ArrayRef<double const>, float, float const (*) [3], float*, float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::Update::update_sd_second_half(t_inputrec const&, long, float*, int, gmx::ArrayRef<ParticleType const>, gmx::ArrayRef<float const>, t_state*, t_commrec const*, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, gmx::Constraints*, bool, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
ListedForces::calculate(gmx_wallcycle*, float const (*) [3], t_lambda const*, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_fcdata*,... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ArrayRef<gmx::MtsLevel const>::ArrayRef<std::vector<gmx::MtsLevel, std::allocator<gmx::MtsLevel> > const&, void>(std::vector<gmx::MtsLevel, std::allocator<gmx::MtsLevel> > const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ArrayRef<unsigned short> gmx::arrayRefFromArray<unsigned short>(unsigned short*, unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
dd_clear_local_constraint_indices(gmx_domdec_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL0dd57185::xdrstdio_putint32(XDR*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__libm_logf_l9 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN11PairlistSet19dispatchPruneKernelEPK16nbnxn_atomdata_tN3gmx8ArrayRefIKNS3_11BasicVectorIfEEEE_68__par_region0_2_0 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
clearForceBuffer(nbnxn_atomdata_t*, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALc39bc2c0::bonded_cg_distance_mol(gmx_moltype_t const*, gmx::DDBondedChecking, bool, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, bonded_distance_t*, bonded_distance_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
ddReopenBalanceRegionCpu(gmx_domdec_t const*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
exp | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
Nbnxm::Grid::sortColumnsCpuGeometry(Nbnxm::GridSetData*, int, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, nbnxn_atomdata_t*, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 4 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmpc_master | libiomp5.so | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_add_nbat_fshift_to_fshift(nbnxn_atomdata_t const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
.plt.sec@start | libc.so.6 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_IO_file_xsputn | libc.so.6 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
adler32 | libmpi.so.12.0.0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 1 | 1 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
_IO_fgets | libc.so.6 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doFloat(float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doFloat(float*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
update_tcouple(long, t_inputrec const*, t_state*, gmx_ekindata_t*, t_extmass const*, int, gmx::ArrayRef<unsigned short const>) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
acosf | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 5 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
void doStopComMotionLinear<3>(t_mdatoms const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, t_vcm const&) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 7 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__kmpc_masked | libiomp5.so | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 6 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
nbnxn_atomdata_add_nbat_fshift_to_fshift(nbnxn_atomdata_t const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
postProcessForces(t_commrec const*, long, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ForceOutputs*, float (*) [3], t_mdatoms const*, t_forcerec const*, gmx::VirtualSitesHandler*, gmx::StepWo... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
erfcf | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx_reverse_top_t::options() const | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
numPbcDimensions(PbcType) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
make_local_bondeds_excls(gmx_domdec_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, bool, int const*, bool, float, t_pbc const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, InteractionDefin... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
sincosf | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 15 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
clearRVecs(gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, bool) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 12 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::Constraints::Impl::apply(bool, bool, long, int, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, float const (*)... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 17 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx_pme_do(gmx_pme_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<flo... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 16 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 |
__libm_expf_l9 | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
_intel_fast_memset | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 11 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::ListOfLists<int>::pushBack(gmx::ArrayRef<int const>) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 15 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::makeAtomsToConstraintsList(int, gmx::ArrayRef<InteractionList const>, gmx::ArrayRef<t_iparams const>, gmx::FlexibleConstraintTreatment) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__intel_rtdd_indep | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 17 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
calc_vcm_grp(t_mdatoms const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_vcm*) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 17 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
atan2f | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 20 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__kmpc_for_static_init_8 | libiomp5.so | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 20 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
PairlistSet::dispatchPruneKernel(nbnxn_atomdata_t const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>) [clone .extracted] | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__kmpc_push_num_threads | libiomp5.so | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
getutmp | libc.so.6 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
dd_move_x_specat(gmx_domdec_t const*, gmx_domdec_specat_comm_t*, float const (*) [3], float (*) [3], float (*) [3], bool) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
check_box(PbcType, float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
v_q_ewald_lr(double, double) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
AtomProxy::residueNumber() const | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
dd_pme_maxshift_x(gmx_domdec_t const&) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
computeAtomGroupDomainIndex(gmx_domdec_t const&, gmx_ddbox_t const&, float const (&) [3][3], gmx::ArrayRef<std::vector<float, std::allocator<float> > const>, int, int, float const (*) [3], float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
ddReopenBalanceRegionCpu(gmx_domdec_t const*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
void std::vector<char, std::allocator<char> >::_M_range_insert<char*>(__gnu_cxx::__normal_iterator<char*, std::vector<char, std::allocator<char> > >, char*, char*, std::forward_iterator_tag) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__libc_alloca_cutoff | libc.so.6 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
reduce_energies_over_lists(nbnxn_atomdata_t const*, int, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
DispersionCorrection::calculate(float const (*) [3], float) const | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
set_dhdl_output(gmx_enerdata_t*, FreeEnergyPerturbationCouplingType, t_lambda const&) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
exp | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
expf | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
__libm_exp_k32 | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
ebin_increase_count(int, t_ebin*, bool) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
xdr_float(XDR*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::Update::update_sd_second_half(t_inputrec const&, long, float*, int, gmx::ArrayRef<ParticleType const>, gmx::ArrayRef<float const>, t_state*, t_commrec const*, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, gmx::Constraints*, bool, bool) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
ListedForces::haveCpuListedForces(t_fcdata const&) const | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
reset_enerdata(gmx_enerdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
setupForceOutputs(ForceHelperBuffers*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::DomainLifetimeWorkload const&, gmx::StepWorkload const&, bool, gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::InMemoryDeserializer::doRvec(float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::constrain_lincs(bool, t_inputrec const&, long, gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVecto... | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 21 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
void do_dih_fup<(BondedKernelFlavor)0>(int, int, int, int, float, float*, float*, float*, float*, float*, float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const (*) [3], int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 18 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 |
__kmpc_bound_num_threads | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 10 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
calc_vir(int, float const (*) [3], float const (*) [3], float (*) [3], bool, float const (*) [3]) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 12 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
sfftw_plan_guru_r2r_ | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
gmx::makeAtomsToConstraintsList(int, gmx::ArrayRef<InteractionList const>, gmx::ArrayRef<t_iparams const>, gmx::FlexibleConstraintTreatment) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
calculateSimpleBond(int, int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*, gmx::ArrayRef<float const>, t_fcdata*, t_disresdata*, t_oriresdata*, int*, BondedKernelFlavor) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 12 | NA | 5 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
dd_make_local_constraints(gmx_domdec_t*, int, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::Constraints*, int, gmx::ArrayRef<InteractionList>) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
fftwf_codelet_n1fv_64_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.04 | NA | NA |
__kmp_run_after_invoked_task | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | 4 | 14 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
nbnxn_atomdata_set(nbnxn_atomdata_t*, Nbnxm::GridSet const&, gmx::ArrayRef<int const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<long const>) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
calc_vcm_grp(t_mdatoms const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_vcm*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 18 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
clear_fshift(float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 9 | NA | 16 | NA | NA | NA | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
acosf | libm.so.6 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 12 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
make_dp_periodic(float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 11 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doUChar(unsigned char*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doUShort(unsigned short*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doInt(int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_parallel_3dfft_real_limits(gmx_parallel_3dfft*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 10 | NA | 21 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx::InMemorySerializer::doInt(int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_dl_mcount | ld-linux-x86-64.so.2 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 1 | 1 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
_INTERNAL3b86f157::copyMovedUpdateGroupCogs(gmx::ArrayRef<int const>, int, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx_domdec_comm_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
int& std::vector<int, std::allocator<int> >::emplace_back<int>(int&&) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
float (anonymous namespace)::idihs<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*, gmx::ArrayRef<float const>, t_fcdata*, t_disresdata*, t_oriresdata*, in... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 9 | NA | 11 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__libm_cos_l9 | gmx_mpi | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 25 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 |
__kmp_fork_call | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
GOMP_barrier | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 15 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::ThreadedForceBuffer<float [4]>::reduce(gmx::ForceWithShiftForces*, float*, gmx_grppairener_t*, gmx::ArrayRef<float>, gmx::StepWorkload const&, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
PairlistSet::constructPairlists(gmx::InteractionLocality, Nbnxm::GridSet const&, gmx::ArrayRef<PairsearchWork>, nbnxn_atomdata_t*, gmx::ListOfLists<int> const&, int, t_nrnb*, SearchCycleCounting*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
clearDDStateIndices(gmx_domdec_t*, bool) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
std::vector<nbnxn_cj_t, std::allocator<nbnxn_cj_t> >::_M_default_append(unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 21 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
make_dd_indices(gmx_domdec_t*, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
parse_printf_format | libc.so.6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_cpy2d | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.06 | NA | NA | 0.05 | NA | NA |
__kmp_GOMP_microtask_wrapper | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 23 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
(anonymous namespace)::calc_one_bond(int, int, InteractionDefinitions const&, gmx::ArrayRef<int const>, int, WorkDivision const&, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_forcerec const*, t_pbc const*, gmx_grppairener_t*, t_nrnb*,... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 23 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_pme_do(gmx_pme_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<flo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 27 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_measure_execution_time | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.03 | NA | NA | 0.02 | NA | NA |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::processMask() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 20 | NA | 12 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
Nbnxm::Grid::setCellIndices(int, int, Nbnxm::GridSetData*, gmx::ArrayRef<Nbnxm::GridWork>, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, int, nbnxn_atomdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__tls_get_addr | ld-linux-x86-64.so.2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 18 | 13 | 27 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
@plt_start@ | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 13 | 1 | 6 | NA | NA | NA | 0.01 | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
__default_morecore | libc.so.6 | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 8 | 2 | NA | NA | NA | NA | 0.02 | 0.00 | NA | 0.01 | 0.00 | NA |
Nbnxm::Grid::calcColumnIndices(Nbnxm::Grid::Dimensions const&, gmx::UpdateGroupsCog const*, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, int, int const*, int, int, gmx::ArrayRef<int>, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 25 | NA | 22 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
fftwf_execute_dft_c2r | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 16 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_execute_dft_r2c | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 20 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
calcVerletBufferSize(gmx_mtop_t const&, float, t_inputrec const&, int, int, float, VerletbufListSetup const&) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
int make_bondeds_zone<true>(gmx_reverse_top_t const&, gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, std::vector<gmx_molblock_t, std::allocator<gmx_molblock_t> > const&, bool, int const*, bo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 19 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_task_team_sync | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 20 | 17 | 23 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_codelet_t2_32 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
dd_check_ftype(int, ReverseTopOptions const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALc226143a::addAtomtype(std::vector<VerletbufAtomtype, std::allocator<VerletbufAtomtype> >*, atom_nonbonded_kinetic_prop_t const&, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
fftwf_elapsed_since | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_twiddle_awake | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_cpy2d_co | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
write_hconf_mtop(_IO_FILE*, char const*, gmx_mtop_t const&, float const (*) [3], float const (*) [3], float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
xdr_vector(XDR*, char*, unsigned int, unsigned int, int (*)(XDR*, void*, ...)) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_ct_applicable | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_n1bv_32_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_api_omp_get_num_threads | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_mkproblem_dft_d | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_n1fv_64_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_t2fv_32_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
GOMP_parallel | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
xdrstdio_putint32(XDR*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
PmeAtomComm::setNumAtoms(int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::EnergyOutput::recordNonEnergyStep() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
CpuPpLongRangeNonbondeds::calculate(gmx_pme_t*, t_commrec const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ForceWithVirial*, gmx_enerdata_t*, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
reset_dvdl_enerdata(gmx_enerdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
add_ebin(t_ebin*, int, int, float const*, bool) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
get_pme_ener_vir_q(pme_solve_work_t*, int, PmeOutput*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::makeLincsDeviations(gmx::Lincs const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_pbc const*) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
nrnbIndex(int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::Update::xp() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_pme_do(gmx_pme_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<flo... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
ListedForces::haveCpuBondeds() const | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
vrescale_resamplekin(float, float, float, float, long, long) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_get_global_thread_id | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
nbnxn_atomdata_copy_shiftvec(bool, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, nbnxn_atomdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_reverse_top_t::hasIntermolecularInteractions() const | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 3 | NA | 6 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
InteractionDefinitions::clear() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 3 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx_reverse_top_t::interactionListForMoleculeType(int) const | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 3 | NA | 7 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__kmp_run_before_invoked_task | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 6 | 11 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
__kmp_acquire_queuing_lock | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 3 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
getGroupType(SimulationGroups const&, SimulationAtomGroupType, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 3 | NA | 6 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
GOMP_parallel_end | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
setupForceOutputs(ForceHelperBuffers*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::DomainLifetimeWorkload const&, gmx::StepWorkload const&, bool, gmx_wallcycle*) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
_dl_rtld_di_serinfo | ld-linux-x86-64.so.2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
low_set_pbc(t_pbc*, PbcType, int const*, float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
dd_make_local_top(gmx_domdec_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, int, float (*) [3], float*, int const*, t_forcerec*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx_localtop_... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_task_team_setup | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_codelet_t3fv_16_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_choose_radix | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_reverse_top_t::molblockIndices() const | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 4 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
inputrecDynamicBox(t_inputrec const*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
dd_check_ftype(int, ReverseTopOptions const&) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
make_local_bondeds_excls(gmx_domdec_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, bool, int const*, bool, float, t_pbc const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, InteractionDefin... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_mkproblem_rdft_1 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::Constraints::apply(bool, bool, long, int, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, float const (*) [3], ... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
std::_Function_handler<gmx::StopSignal (), gmx::StopHandlerBuilder::getStopHandlerMD(gmx::compat::not_null<gmx::SimulationSignal*>, bool, bool, int, bool, int, float, bool, _IO_FILE*, long const&, bool const&, gmx_walltime_accounting*)::{l... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx::SettleData::setConstraints(InteractionList const&, int, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
fftwf_md5putb | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
ListedForces::calculate(gmx_wallcycle*, float const (*) [3], t_lambda const*, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_fcdata*,... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
fftwf_cpy1d | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doInt(int*) | libgromacs_mpi.so.7 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |
gmx::constr_recur(gmx::ListOfLists<int> const&, std::array<InteractionList, 94ul> const&, gmx::ArrayRef<t_iparams const>, bool, int, int, int, gmx::ArrayRef<int>, float, float, float*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_rdft2_inplace_strides | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_r2cbIII_12 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_mkplan_rdft | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_hc2hc_applicable | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_transpose_tiled | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_t1fuv_8_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_q1fv_5_avx | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_release_queuing_lock | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
operator new(unsigned long) | libstdc++.so.6.0.31 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
GOMP_atomic_end | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
GOMP_atomic_start | libiomp5.so | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_resume_if_soft_paused | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 5 | 13 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_cpy2d_tiledbuf | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_mktensor_2d | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_assertion_failed | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_cpy2d_ci | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::constrain_lincs(bool, t_inputrec const&, long, gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVecto... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
fftwf_codelet_n2fv_64_sse2 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_tensor_compress_contiguous | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_malloc_plain | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_ifree0 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
_dl_audit_symbind_alt | ld-linux-x86-64.so.2 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
void std::vector<int, std::allocator<int> >::_M_realloc_insert<int const&>(__gnu_cxx::__normal_iterator<int*, std::vector<int, std::allocator<int> > >, int const&) | gmx_mpi | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_plan_awake | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
NPT_energy(t_inputrec const*, t_state const*, t_extmass const*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_omp_get_thread_num() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 8 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx::InMemorySerializer::doInt(int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
computeMoveFlag(gmx_domdec_t const&, int const (&) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::ObservablesReducer::markAsReadyToReduce() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
set_zones_size(gmx_domdec_t*, float (*) [3], gmx_ddbox_t const*, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
dd_clear_local_constraint_indices(gmx_domdec_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
distributeVec(gmx_domdec_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
AtomIterator::operator++() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::ImdSession::Impl::run(long, bool, float const (*) [3], gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, double) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::ImdSession::dd_make_local_IMD_atoms(gmx_domdec_t const*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::do_constrain_first(_IO_FILE*, gmx::Constraints*, t_inputrec const*, int, int, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, float const (*) [3], float) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx::Constraints::Impl::apply(bool, bool, long, int, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, float const (*)... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx::InMemoryDeserializer::doRvec(float (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
computeAtomGroupDomainIndex(gmx_domdec_t const&, gmx_ddbox_t const&, float const (&) [3][3], gmx::ArrayRef<std::vector<float, std::allocator<float> > const>, int, int, float const (*) [3], float (*) [3]) [clone .isra.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
clear_pairlist(NbnxnPairlistCpu*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
std::vector<nbnxn_cj_t, gmx::DefaultInitializationAllocator<nbnxn_cj_t, std::allocator<nbnxn_cj_t> > >::_M_default_append(unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
Nbnxm::Grid::setCellIndices(int, int, Nbnxm::GridSetData*, gmx::ArrayRef<Nbnxm::GridWork>, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, int, nbnxn_atomdata_t*) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
hwloc__xml_import_object | libopen-pal.so.40.10.1 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::InMemoryDeserializer::doReal(float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
void std::vector<nbnxn_ci_t, gmx::DefaultInitializationAllocator<nbnxn_ci_t, std::allocator<nbnxn_ci_t> > >::_M_realloc_insert<nbnxn_ci_t const&>(__gnu_cxx::__normal_iterator<nbnxn_ci_t*, std::vector<nbnxn_ci_t, gmx::Defau... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
Nbnxm::Grid::setDimensions(int, int, gmx::BasicVector<float>, gmx::BasicVector<float>, float, float, bool, gmx::PinningPolicy) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
nonbonded_verlet_t::dispatchNonbondedKernel(gmx::InteractionLocality, interaction_const_t const&, gmx::StepWorkload const&, int, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>, t_nrn... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
Nbnxm::GridSet::putOnGrid(float const (*) [3], int, float const*, float const*, gmx::UpdateGroupsCog const*, gmx::Range<int>, float, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, int, int const*, nbnxn_ato... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
nonbonded_verlet_t::atomdata_add_nbat_f_to_f(gmx::AtomLocality, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
nonbonded_verlet_t::isDynamicPruningStepCpu(long) const | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_reverse_top_t::molblockIndices() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 4 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_IO_fwrite | libc.so.6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
dd_bonded_cg_distance(gmx::MDLogger const&, gmx_mtop_t const&, t_inputrec const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float const (*) [3], gmx::DDBondedChecking, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
_INTERNAL80d859f8::make_local_bondeds_excls(gmx_domdec_t const&, gmx_domdec_zones_t const&, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, bool, int const*, bool, float, t_pbc const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 5 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA |
_INTERNALb293ce76::next_ci(Nbnxm::Grid const&, int, int, int*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 10 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::set_lincs(InteractionDefinitions const&, int, gmx::ArrayRef<float const>, float, bool, t_commrec const*, gmx::Lincs*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.05 | NA | NA | 0.02 | NA |
void _INTERNAL83cfe191::orderVector<int>(gmx::ArrayRef<gmx_cgsort const>, gmx::ArrayRef<int>, gmx::ArrayRef<int>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void _INTERNALa73835ba::doStopComMotionLinear<3>(t_mdatoms const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, t_vcm const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 11 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
clear_fshift(float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 9 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
dd_make_local_constraints(gmx_domdec_t*, int, gmx_mtop_t const&, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::Constraints*, int, gmx::ArrayRef<InteractionList>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
SplineCoefficients::realloc(int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
mkl_dft_avx512_transfer_ipp_mkl_error@plt | libmkl_avx512.so.2 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 18 | 18 | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | NA | 0.00 | 0.00 |
gmx_parallel_3dfft_real_limits(gmx_parallel_3dfft*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 8 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALa817b2b7::nbnxn_atomdata_set_ljcombparams(nbnxn_atomdata_t::Params*, int, Nbnxm::GridSet const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::SettleData::hw3() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 6 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
do_pairs(int, int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float const*, float*, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<float>, gmx::ArrayRef<bool>, gmx::ArrayRef<unsigned short>, ... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 9 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_t::resizeForceBuffers() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::processMask() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 11 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nral_rt(int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 11 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__libm_cos_l9 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 13 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__Z12reduceForcesP16nbnxn_atomdata_tN3gmx12AtomLocalityERKN5Nbnxm7GridSetEPA3_f_1262__par_region0_2_48 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 13 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
cos | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 10 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
std::vector<int, std::allocator<int> >::_M_default_append(unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::csettle(gmx::SettleData const&, int, int, t_pbc const*, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> >, float, gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<flo... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 9 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_parallel_3dfft_complex_limits(gmx_parallel_3dfft*, int*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 10 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALb293ce76::addNewIEntry(NbnxnPairlistCpu*, int, int, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 13 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
L__ZN17_INTERNALb293ce7620rebalanceSimpleListsEN3gmx8ArrayRefIK16NbnxnPairlistCpuEENS1_IS2_EENS1_I14PairsearchWorkEE_3681__par_region0_2_143 | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 9 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
atan2f | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 39 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::assign_constraint(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs*, int, int, int, float, float, _INTERNAL1bba7552::gmx::ListOfLists<int> const&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
__kmpc_global_thread_num | libiomp5.so | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 7 | 2 | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 |
gmx_reverse_top_t::hasPositionRestraints() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 5 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_reverse_top_t::interactionListForMoleculeType(int) const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 4 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALd0075a52::mk_grey(gmx::ArrayRef<egCol>, t_graph*, int*, int, float const (*) [3], float const (*) [3], int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
constrained_atom_sigma2(float, atom_nonbonded_kinetic_prop_t const*, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::SettleData::setConstraints(InteractionList const&, int, gmx::ArrayRef<float const>, gmx::ArrayRef<float const>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL3b86f157::clear_and_mark_ind(gmx::ArrayRef<int const>, gmx::ArrayRef<int const>, gmx_ga2la_t*, int*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL5ce61142::Nbnxm::combine_bounding_box_pairs(_INTERNAL5ce61142::Nbnxm::Grid const&, gmx::ArrayRef<_INTERNAL5ce61142::Nbnxm::BoundingBox const>, gmx::ArrayRef<_INTERNAL5ce61142::Nbnxm::BoundingBox>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::set_lincs_matrix(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs*, _INTERNAL1bba7552::gmx::ArrayRef<float const>, float) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALb293ce76::set_icell_bb_simple(gmx::ArrayRef<Nbnxm::BoundingBox const>, int, float, float, float, Nbnxm::BoundingBox*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 5 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
erfcf | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNALa817b2b7::nbnxn_atomdata_set_charges(nbnxn_atomdata_t*, Nbnxm::GridSet const&, gmx::ArrayRef<float const>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void _INTERNAL83cfe191::orderVector<long>(gmx::ArrayRef<gmx_cgsort const>, gmx::ArrayRef<long>, gmx::ArrayRef<long>) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::SettleData::ow1() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 7 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nbnxn_atomdata_t::~nbnxn_atomdata_t() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL3b86f157::copyMovedAtomsToBufferPerAtom(gmx::ArrayRef<int const>, int, int, float (*) [3], gmx_domdec_comm_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL83cfe191::dd_sort_order_nbnxn(t_forcerec const*, std::vector<gmx_cgsort, std::allocator<gmx_cgsort> >*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ThreadForceBuffer<float [4]>::~ThreadForceBuffer() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
expf | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_parallel_3dfft_execute(gmx_parallel_3dfft*, gmx_fft_direction, int, gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 5 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
getGroupType(SimulationGroups const&, SimulationAtomGroupType, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 7 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::LegacySimulator::do_md() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_omp_get_thread_num() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 6 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx_reverse_top_t::hasIntermolecularInteractions() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 6 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
calc_vcm_grp(t_mdatoms const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, t_vcm*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 12 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
std::vector<float, gmx::Allocator<float, gmx::HostAllocationPolicy> >::_M_default_append(unsigned long) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>::swap(gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector<float> const>&) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 14 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ArrayRef<Nbnxm::BoundingBox const>::ArrayRef<std::vector<Nbnxm::BoundingBox, gmx::Allocator<Nbnxm::BoundingBox, gmx::AlignedAllocationPolicy> > const&, void>(std::vector<Nbnxm::BoundingBox, gmx::Allocator<Nbnxm::Bound... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 17 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::vector<nbnxn_cj_t, gmx::DefaultInitializationAllocator<nbnxn_cj_t, std::allocator<nbnxn_cj_t> > >::_M_realloc_insert<nbnxn_cj_t const&>(__gnu_cxx::__normal_iterator<nbnxn_cj_t*, std::vector<nbnxn_cj_t, gmx::Defau... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 4 | NA | 2 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
gmx_reverse_top_t::hasPositionRestraints() const | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 5 | NA | 2 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__libc_malloc | libc.so.6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 | 3 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_rdft2_rank0_register | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
fftwf_md5putc | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 4 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
do_stopcm_grp(t_mdatoms const&, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> >, t_vcm const&) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 10 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
__kmp_api_omp_get_thread_num | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 6 | 7 | 9 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
Unknown function | [vdso] | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 2 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.03 | NA | 0.00 | 0.02 | NA | 0.00 |
gmx_parallel_3dfft_execute(gmx_parallel_3dfft*, gmx_fft_direction, int, gmx_wallcycle*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 5 | NA | 2 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
dd_redistribute_cg(_IO_FILE*, long, gmx_domdec_t*, int*, t_state*, t_forcerec*, t_nrnb*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
fftwf_codelet_r2cf_64 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
next_ci(Nbnxm::Grid const&, int, int, int*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 8 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::LegacySimulator::do_md() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
constrained_atom_sigma2(float, atom_nonbonded_kinetic_prop_t const*, float*, float*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
getVerletBufferAtomtypes(gmx_mtop_t const&, bool, bool) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
do_force(_IO_FILE*, t_commrec const*, gmx_multisim_t const*, t_inputrec const&, gmx::Awh*, gmx_enfrot*, gmx::ImdSession*, pull_t*, long, t_nrnb*, gmx_wallcycle*, gmx_localtop_t const*, float const (*) [3], gmx::ArrayRefWithPadding<gmx::BasicVector&l... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
mk_mshift(_IO_FILE*, t_graph*, PbcType, float const (*) [3], float const (*) [3]) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
copyMovedAtomsToBufferPerAtom(gmx::ArrayRef<int const>, int, int, float (*) [3], gmx_domdec_comm_t*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::set_lincs_matrix(gmx::Lincs*, gmx::ArrayRef<float const>, float) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
getThreadAtomRange(int, int, int, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 4 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_cpy2d_pair | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
timer_settime | libc.so.6 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
__kmp_join_call | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
__kmp_allocate_team | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
splinedata_t::~splinedata_t() | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
PairlistSet::dispatchPruneKernel(nbnxn_atomdata_t const*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>) [clone ._omp_fn.0] | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 7 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
fftwf_codelet_r2cb_32 | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
_INTERNAL1bba7552::gmx::lincs_thread_setup(_INTERNAL1bba7552::gmx::Lincs*, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
_INTERNAL83cfe191::clearDDStateIndices(gmx_domdec_t*, bool) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::ThreadedForceBuffer<float [4]>::reduce(gmx::ForceWithShiftForces*, float*, gmx_grppairener_t*, gmx::ArrayRef<float>, gmx::StepWorkload const&, int) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
void std::allocator_traits<gmx::Allocator<float, gmx::HostAllocationPolicy> >::_S_destroy<gmx::Allocator<float, gmx::HostAllocationPolicy>, float>(gmx::Allocator<float, gmx::HostAllocationPolicy>&, float*, ...) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
nral_rt(int) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 9 | NA | 13 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
Nbnxm::Grid::setCellIndices(int, int, Nbnxm::GridSetData*, gmx::ArrayRef<Nbnxm::GridWork>, gmx::Range<int>, gmx::ArrayRef<long const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, int, nbnxn_atomdata_t*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
float _INTERNALc075c6e4::(anonymous namespace)::idihs<(BondedKernelFlavor)2>(int, int const*, t_iparams const*, float const (*) [3], float (*) [4], float (*) [3], t_pbc const*, float, float*, gmx::ArrayRef<float const>, t_fcdata*, t_disresdata*... | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 20 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::make_at2con(int, gmx::ArrayRef<InteractionList const>, gmx::ArrayRef<t_iparams const>, gmx::FlexibleConstraintTreatment) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
gmx::SettleData::hw2() const | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 14 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA |
make_dp_periodic(float*) | libgromacs_mpi.so.7.0.0 | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 15 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.00 | NA |
fftwf_isqrt | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx::assign_constraint(gmx::Lincs*, int, int, int, float, float, gmx::ListOfLists<int> const&) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
_IO_vfprintf | libc.so.6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_kdft_dif_register | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | NA | NA | 0.01 | NA | NA |
__xpg_basename | libc.so.6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
compute_globals(gmx_global_stat*, t_commrec*, t_inputrec const*, t_forcerec*, gmx_ekindata_t*, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, gmx::ArrayRef<gmx::BasicVector<float> const>, float const (*) [3], t_mdatoms const*, t_nrnb... | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__kmp_acquire_ticket_lock | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
__kmp_internal_fork | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
exp | libm.so.6 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
Nbnxm::GridSet::setLocalAtomOrder() | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 1 | NA | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
__kmp_release_ticket_lock | libiomp5.so | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
fftwf_dft_r2hc_register | libfftw3f.so.3.6.10 | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 2 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 | NA | NA |
gmx_parallel_3dfft_complex_limits(gmx_parallel_3dfft*, int*, int*, int*, int*) | libgromacs_mpi.so.7 | 0 | NA | 0 | 0 | NA | 0 | 7 | NA | 13 | NA | NA | NA | 0.00 | NA | 0.00 | 0.00 | NA | 0.00 |
mkl_dft_avx512_ippsFFTFwd_RToPerm_32f@plt | libmkl_avx512.so.2 | NA | NA | 0 | NA | NA | 0 | NA | NA | 1 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | NA | NA | 0.00 |